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J-GLOBAL ID：201802265359568326   整理番号：18A1152806

Plasmodium 18S rRNAとスプライスされた配偶子特異的mRNAのための多重,DNアーゼを用いない一段階逆転写PCR【JST・京大機械翻訳】

Multiplex, DNase-free one-step reverse transcription PCR for Plasmodium 18S rRNA and spliced gametocyte-specific mRNAs

著者 (22件)： Hanron Amelia E. (Department of Laboratory Medicine, University of Washington, Seattle, USA) ,  Billman Zachary P. (Department of Laboratory Medicine, University of Washington, Seattle, USA) ,  Billman Zachary P. (Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, University of Washington, Seattle, USA) ,  Seilie Annette M. (Department of Laboratory Medicine, University of Washington, Seattle, USA) ,  Olsen Tayla M. (Department of Laboratory Medicine, University of Washington, Seattle, USA) ,  Fishbaugher Matthew (Center for Infectious Disease Research, Seattle, USA) ,  Chang Ming (Department of Laboratory Medicine, University of Washington, Seattle, USA) ,  Rueckle Thomas (Medicines for Malaria Venture, Geneva, Switzerland) ,  Andenmatten Nicole (Medicines for Malaria Venture, Geneva, Switzerland) ,  Greenhouse Bryan (Division of HIV, Infectious Diseases and Global Medicine, Department of Medicine, University of California San Francisco, San Francisco, USA) ,  Arinaitwe Emmanuel (Infectious Diseases Research Collaboration, Kampala, Uganda) ,  Arinaitwe Emmanuel (London School of Hygiene & Tropical Medicine, London, UK) ,  Rek John (Infectious Diseases Research Collaboration, Kampala, Uganda) ,  Das Smita (PATH, Seattle, USA) ,  Domingo Gonzalo J. (PATH, Seattle, USA) ,  Shipman Kelly (Seattle Malaria Clinical Trials Center, Fred Hutch Cancer Research Center, Seattle, USA) ,  Kappe Stefan H. (Center for Infectious Disease Research, Seattle, USA) ,  Kublin James G. (Seattle Malaria Clinical Trials Center, Fred Hutch Cancer Research Center, Seattle, USA) ,  Murphy Sean C. (Department of Laboratory Medicine, University of Washington, Seattle, USA) ,  Murphy Sean C. (Department of Microbiology, University of Washington, Seattle, USA) ,  Murphy Sean C. (Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, University of Washington, Seattle, USA) ,  Murphy Sean C. (Center for Infectious Disease Research, Seattle, USA)
資料名： Malaria Journal (Web)  (Malaria Journal (Web))
巻： 16  号： 1  ページ： 208  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7332A  ISSN： 1475-2875  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Plasmodium配偶子は,雌のAnopheles蚊に伝達される性的な段階である。マラリア原虫はGiemsa染色血液スミア上で顕微鏡的に識別できるが,分子法はそれらの増加した感度のためにますます使用されている。配偶子細胞の分子検出は無性および性段階寄生虫を識別する方法を必要とする。一般的に試験されている配偶子特異的mRNAは,逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)により検出されるPfs25およびPFS230である。しかしながら,これらの非スプライシングmRNA標的の検出は,共精製ゲノムDNAを除去するために核酸の前処理DNアーゼ処理を必要とする。配偶子特異的スプライシングmRNAを同定することができれば,DNアーゼ処理は除去でき,一段階多重化分子法を利用できた。【結果】発現データを用いて,非配偶子細胞期におけるアンチセンスRNA発現において低い成熟配偶子細胞における高度に発現したmRNAを同定した。多数の候補mRNAを試験した後に,スプライスメスPf3D7_0630000 mRNAをPlasmodium falciparumの配偶子特異的バイオマーカーとして選択し,Plasmodium 18S rRNA RT-PCRと適合させた。このmRNAは成熟配偶子を含む試料でのみ検出され,無性期寄生虫または非感染ヒト血液のみを含む試料では検出されなかった。PF3D7_0630000RT-PCRは,スパイクおよび臨床試料の両方において広範囲の寄生虫密度を通して配偶子を検出し,RT-PCRに基づく配偶子細胞検出のためのゴールドスタンダード,Pfs25RT-PCRと一致した。Plasmodium18S rRNA RT-PCRにより多重化したPF3D7_0630000は,一段階RT-PCR配偶子細胞検出のための他のスプライシングmRNA標的よりも高感度であった。結論:スプライシングされた標的はDNase処理を必要としないので,PF3D7_0630000分析は,全ヒト血液からの配偶子の直接一段階検出のために,Plasmodium18S rRNAで多重化できる。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 寄生虫 ,  *DNアーゼ ,  ヒト ,  *RT-PCR法 ,  *mRNA ,  Plasmodium falciparum ,  バイオマーカー ,  *rRNA ,  *マラリア原虫 ,  アンチセンスRNA ,  前処理 ,  感染 ,  高感度 ,  *配偶子 ,  マラリア

著者キーワード (6件)： 配偶子 ,  mRNA ,  スプライス ,  アンチセンス ,  マラリア ,  DNアーゼ

分類 (2件)： 分化,増殖,成長,生殖  (EG03055B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (39件)：

• J Infect Dis; Piperaquine monotherapy of drug-susceptible Plasmodium falciparum infection results in rapid clearance of parasitemia but is followed by the appearance of gametocytemia; CJ Pasay, R Rockett, S Sekuloski, P Griffin, L Marquart, C Peatey; 214; 2016; 105-113; 10.1093/infdis/jiw128; CR1;
• PLoS One; Substantial contribution of submicroscopical Plasmodium falciparum gametocyte carriage to the infectious reservoir in an area of seasonal transmission; AL Ouedraogo, T Bousema, P Schneider, SJ Vlas, E Ilboudo-Sanogo, N Cuzin-Ouattara; 4; 2009; e8410; 10.1371/journal.pone.0008410; CR2;
• Mol Biochem Parasitol; Detection of low level Plasmodium falciparum gametocytes using reverse transcriptase polymerase chain reaction; HA Babiker, A Abdel-Wahab, S Ahmed, S Suleiman, L Ranford-Cartwright, R Carter; 99; 1999; 143-148; 10.1016/S0166-6851(98)00175-3; CR3;
• Parasitology; Plasmodium falciparum gametocytes: their longevity and infectivity; ME Smalley, RE Sinden; 74; 1977; 1-8; 10.1017/S0031182000047478; CR4;
• Am J Trop Med Hyg; Infectivity to mosquitoes of Plasmodium falciparum as related to gametocyte density and duration of infection; GM Jeffery, DE Eyles; 4; 1955; 781-789; 10.4269/ajtmh.1955.4.781; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： Plasmodium ,  rRNA ,  配偶子 ,  mRNA ,  多重 ,  DNアーゼ ,  段階 ,  逆転写PCR