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J-GLOBAL ID：201802265421871496   整理番号：18A1721613

ラットβ-パルブアルブミンの構造と機能における‘ブラック’と‘グレイ’クラスターの役割の包括的分析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive analysis of the roles of ‘black’ and ‘gray’ clusters in structure and function of rat β-parvalbumin

著者 (15件)： Permyakov Sergei E. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Permyakov Sergei E. (Department of Biomedical Engineering, Pushchino State Institute of Natural Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Vologzhannikova Alisa A. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Khorn Polina A. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Shevelyova Marina P. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Kazakov Alexei S. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Emelyanenko Victor I. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Denesyuk Alexander I. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Denesyuk Alexander I. (Structural Bioinformatics Laboratory, Faculty of Science and Engineering, Åbo Akademi University, Turku, 20520, Finland) ,  Denessiouk Konstantin (Structural Bioinformatics Laboratory, Faculty of Science and Engineering, Åbo Akademi University, Turku, 20520, Finland) ,  Denessiouk Konstantin (Pharmaceutical Sciences Laboratory, Faculty of Science and Engineering, Pharmacy, Åbo Akademi University, Turku, 20520, Finland) ,  Uversky Vladimir N. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Uversky Vladimir N. (Department of Molecular Medicine and USF Health Byrd Alzheimer’s Research Institute, Morsani College of Medicine, University of South Florida, Tampa, FL, 33612, USA) ,  Permyakov Eugene A. (Institute for Biological Instrumentation of the Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia) ,  Permyakov Eugene A. (Department of Biomedical Engineering, Pushchino State Institute of Natural Sciences, Pushchino, Moscow Region, 142290, Russia)
資料名： Cell Calcium  (Cell Calcium)
巻： 75  ページ： 64-78  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0875A  ISSN： 0143-4160  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近,EFハンドカルシウム結合蛋白質ファミリーの蛋白質において2つの高度に保存された構造モチーフを見出した。これらのモチーフはCa2+結合ループの支持足場を提供し,EFハンドドメインの疎水性コアに寄与する。各構造モチーフはクラスタI(’黒色’クラスタ)とクラスタII(’灰色’クラスタ)と呼ばれる3つのアミノ酸のクラスタを形成する。クラスタIは非常に保存され,ほとんど芳香族アミノ酸を取り込んだ。対照的に,クラスタIIは芳香族,疎水性及び極性アミノ酸の混合物を含む。ラットβパルブアルブミンにおける「黒色」および「灰色」クラスタは,それぞれF48,A100,F103およびG61,L64,M87から成る。本研究では,Valにより置換されたAla100を除いて,Alaによりこれらのアミノ酸残基を順次置換した。変異体の物理的性質を円偏光二色性,走査熱量測定,動的光散乱,化学的架橋,蛍光プローブ法により調べた。これらの変異体のCa2+およびMg2+結合親和性を,固有蛍光および平衡透析法により評価した。ラットβパルブアルブミン構造及び機能状態の維持に対する「黒色」及び「灰色」クラスタの分離アミノ酸残基の寄与の複雑なパターンにもかかわらず,クラスタIのアラニン置換はアポ型の流体力学的半径,Ca2+/Mg2+負荷型の熱安定性及びクラスタIIのアミノ酸置換による変化と比較してCa2+結合の全エネルギーの顕著な変化を引き起こした。これらの知見は,ラットβパルブアルブミンの内因性障害素因に及ぼすこれらの突然変異の影響の計算解析の出力によりさらに支持され,局所的内因性不規則性と予測障害の全体レベルはクラスタIの突然変異により強く影響されたが,クラスタIIの変異は顕著な影響を示さなかった。これらの結果は,クラスタIのアミノ酸が,クラスタIIの残基と比較して,蛋白質の構造的機能特性の維持に,より本質的な寄与を提供することを示している。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *クラスタ ,  熱量測定 ,  アミノ酸残基 ,  突然変異 ,  疎水性 ,  極性 ,  動的光散乱 ,  円偏光二色性 ,  熱安定性 ,  *ラット ,  *パルブアルブミン ,  アミノ酸
準シソーラス用語： アミノ酸置換 ,  結合親和性 ,  蛍光プローブ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： パルブアルブミン ,  クラスタ ,  構造 ,  機能 ,  次数 ,  障害

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (7件)： ラット ,  パルブアルブミン ,  ブラック ,  グレイ ,  クラスター ,  役割 ,  分析