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J-GLOBAL ID：201802265709808500   整理番号：18A0853673

Tagetes erectaのトランスクリプトーム解析は花発生中の二次代謝産物生合成への新規洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

The transcriptome analyses of Tagetes erecta provides novel insights into secondary metabolite biosynthesis during flower development

著者 (16件)： Feng Guodong (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Huang Shengxiong (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Liu Ying (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Xiao Fangming (Department of Plant Sciences, University of Idaho, Moscow, ID 83844-2339, USA) ,  Liu Jian (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Zhang Zheng (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Chen Qiang (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Mao Yun (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Cao Xulv (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Wang Yang (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Chen Danyang (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Zhou Yu (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Yu Fengyuan (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Liu Guoqing (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Liu Yongsheng (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China) ,  Niu Xiangli (School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 660  ページ： 18-27  発行年： 2018年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Tagetes erectaのゲノムおよびトランスクリプトーム配列は,その栄養的および経済的価値にもかかわらず,公共データベースにおいて非常に限られている。本研究では,9つのcDNAライブラリーを葉,未成熟および成熟花から構築し,Illina Hiseq2000を用いて配列決定した。45.66以上のGbヌクレオチドが生成され,全部で72,499の単一遺伝子が組み立てられ,34,892(48.13%)がNR,Swiss-prot,COG,GO,KOG,KEGGおよびPfamで注釈された。11,721の差次的に発現した遺伝子は,葉,未成熟花および成熟花において同定された。未熟花と成熟花の間の差次的に発現した遺伝子は,主に光合成と二次代謝産物生合成に関与した。さらに,触媒関連の単一遺伝子とカロチノイド生合成に関与するそれらの発現を決定した。内部制御として新たに同定された参照遺伝子を用いて,カロチノイド生合成遺伝子の発現プロファイルをリアルタイムqRT-PCRにより検証し,一つの遺伝子のうちの4つを完全長配列確認のためにクローン化した。さらに,遺伝子拡大はカロチノイド生合成経路における触媒遺伝子ファミリーの間で起こり,T.erectaにおける高色素含量を説明する可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *トランスクリプトーム ,  *二次代謝産物 ,  光合成 ,  データベース ,  ヌクレオチド ,  *生合成 ,  ゲノム ,  クローン
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  カロチノイド生合成 ,  cDNAライブラリー ,  *トランスクリプトーム解析 ,  *マリーゴールド , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Tagetes erecta ,  RNA-seq ,  カロチノイド ,  参照遺伝子 ,  発現プロファイル

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： Tagetes ,  トランスクリプトーム解析 ,  花 ,  二次代謝産物 ,  生合成 ,  洞察