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J-GLOBAL ID：201802266026458985   整理番号：18A1153622

ヒトインフルエンザチャレンジ試験における自己申告症状スコアの代替としての客観的遺伝子発現パネルの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of an objective gene expression panel as an alternative to self-reported symptom scores in human influenza challenge trials

著者 (11件)： Muller Julius (The Jenner Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Parizotto Eneida (The Jenner Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Antrobus Richard (The Jenner Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Francis James (Immune Targeting Systems Ltd (now AltImmune Ltd), 2 Royal College Street, London, UK) ,  Bunce Campbell (Immune Targeting Systems Ltd (now AltImmune Ltd), 2 Royal College Street, London, UK) ,  Stranks Amanda (The Jenner Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Nichols Marshall (Center for Applied Genomics and Precision Medicine, Duke University Medical Centre, Durham, USA) ,  McClain Micah (Center for Applied Genomics and Precision Medicine, Duke University Medical Centre, Durham, USA) ,  Hill Adrian V. S. (The Jenner Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Ramasamy Adaikalavan (The Jenner Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Gilbert Sarah C. (The Jenner Institute, University of Oxford, Oxford, UK)
資料名： Journal of Translational Medicine (Web)  (Journal of Translational Medicine (Web))
巻： 15  号： 1  ページ： 134  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7330A  ISSN： 1479-5876  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】インフルエンザチャレンジ試験は,ワクチン有効性試験のために重要である。現在,疾患重症度は,自己申告スコアにより,高度に主観的な症状のリストに決定される。より客観的な測定はデータ解析の改善を可能にする。【方法】21人のボランティアがインフルエンザチャレンジ試験に参加した。著者らは,16のインフルエンザ症状のリストのために,スコア(DSS)の毎日の合計を計算した。ベースラインおよび24,48,72および96時間後に採取した全血を,Illina HT12v4マイクロアレイでプロファイリングした。DSSと最も強く相関している遺伝子発現の変化をランダムフォレストモデルを訓練するために選択し,異なるマイクロアレイプラットフォーム上でプロファイリングされた41の個体とqRT-PCRによって分析された33のボランティアから成る2つの独立した試験セットで試験した。結果:1456のプローブは,1%の偽発見率でDSSと有意に関連している。ランダムな森林モデルを訓練するために最大の褶曲変化を持つ19の遺伝子を選択した。最初の試験セットにおける予測値と実際のスコアとの間に良好な一致(r=0.57;RMSE=-16.1%)が観察され,約72時間後に収集されたサンプルで最大の一致が得られた。したがって,qRT-PCRにより2回目の試験セットにおいてベースラインおよび72時間後に採取された試料を分析し,良好な一致を観察した(r=0.81;RMSE=-36.1%)。結論:2つの独立したデータセットで検証されたDSSを予測するために19遺伝子qRT-PCRパネルを開発した。トランスクリプトームに基づくパネルは,将来のインフルエンザチャレンジ研究における症状評価のより客観的な尺度を提供することができた。治験登録サンプルは,臨床試験からClinicalTrials.gov Identifierにより得られた:NCT02014870,最初に2013年12月5日に登録された。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子発現 ,  データ解析 ,  モデル ,  *パネル ,  トランスクリプトーム ,  臨床試験 ,  バイオマーカー ,  プローブ ,  *遺伝子 ,  *インフルエンザ ,  ボランティア
準シソーラス用語： プロファイリング ,  マイクロアレイ ,  全血 ,  *スコア , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： インフルエンザ ,  挑戦試験 ,  症状スコア ,  バイオマーカー ,  トランスクリプトーム

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (31件)：

• Lancet Infect Dis; Efficacy and effectiveness of influenza vaccines: a systematic review and meta-analysis; MT Osterholm, NS Kelley, A Sommer, EA Belongia; 12; 2012; 36-44; 10.1016/S1473-3099(11)70295-X; CR1;
• Open Forum Infect Dis; Influenza vaccine effectiveness against drifted versus vaccine-like A/H3N2 viruses during the 2014-15 influenza season-US flu VE network; AM Fry, L Gubareva, R Garten, J Clippard, V Mishin, S Spencer; 2; suppl; 2015; 1; CR2;
• Pediatrics; Seasonal effectiveness of live attenuated and inactivated influenza vaccine; JR Chung, B Flannery, MG Thompson, M Gaglani, ML Jackson, AS Monto; 137; 2016; e20153279; 10.1542/peds.2015-3279; CR3;
• Nohynek H, Baum U, Syrjänen R, Ikonen N, Sundman J, Jokinen J. Effectiveness of the live attenuated and the inactivated influenza vaccine in two-year-olds-a nationwide cohort study Finland, influenza season 2015/16. Eurosurveillance. 2016;21. doi:10.2807/1560-7917.ES.2016.21.38.30346.
• Vaccine; Oral administration of an adenovirus vector encoding both an avian influenza A hemagglutinin and a TLR3 ligand induces antigen specific granzyme B and IFN-γ T cell responses in humans; W Peters, JR Brandl, JD Lindbloom, CJ Martinez, CD Scallan, GR Trager; 31; 2013; 1752-1758; 10.1016/j.vaccine.2013.01.023; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： ヒトインフルエンザ ,  試験 ,  自己申告 ,  症状スコア ,  代替 ,  遺伝子発現 ,  開発