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J-GLOBAL ID：201802266383567450   整理番号：18A0922399

RNAに基づく分析はコケDicranum scopariumにおける老化勾配により構造化された真菌群集を明らかにし,推定多栄養真菌の存在を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

RNA-based analyses reveal fungal communities structured by a senescence gradient in the moss Dicranum scoparium and the presence of putative multi-trophic fungi

著者 (6件)： Chen Ko-Hsuan (Department of Biology, Duke University, Durham, NC, 27708, USA) ,  Liao Hui-Ling (Department of Biology, Duke University, Durham, NC, 27708, USA) ,  Liao Hui-Ling (Soil and Water Sciences Department, North Florida Research and Education Center, University of Florida, Quincy, FL, 32351, USA) ,  Arnold A. Elizabeth (School of Plant Sciences and Department of Ecology and Evolutionary Biology, University of Arizona, Tucson, AZ, 85721, USA) ,  Bonito Gregory (Department of Plant, Soil and Microbial Sciences, Michigan State University, East Lansing, MI, 48824, USA) ,  Lutzoni Francois (Department of Biology, Duke University, Durham, NC, 27708, USA)
資料名： New Phytologist  (New Phytologist)
巻： 218  号： 4  ページ： 1597-1611  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0319B  ISSN： 0028-646X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多様な植物関連菌類は,死んだ植物組織と生きている植物組織の両方から分離できるので,共生栄養状態と腐栄養状態を持つと考えられている。しかし,そのような組織はしばしば時間と空間で分離され,植物老化の様々な段階での真菌活性は菌類群集研究で直接的に評価されていない。著者らは,隣接する生きている,老化および死んだ組織における活性真菌群集の分布を理解するために,Dicranum scoparium(Bryophyta)の野生収集配偶体内の自然老化勾配を横切る活性菌類群集を検出するために,真菌リボソームRNAメタトランスクリプトを用いた。Ascomycotaは老化勾配を通して全ての組織で活性であった。対照的に,Basidiomycotaは,老化および死んだ組織において一般的で活性であった。いくつかの真菌類が生きている組織と死んだ組織で活性として検出され,それらの多重栄養に対する能力を示唆した。メタトランスクリプトにより検出された群集集合の違いを,cDNAのアンプリコン配列決定によりエコーし,培養に基づく推論および野外における真菌体の観察と比較した。cDNAとmetatranscriptomicsのアンプリコン配列決定の組合せは,複雑な微生物多様性を持つ共生系の研究に有望であり,それらの存在と活性の同時検出を可能にする。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *真菌類 ,  rRNA ,  栄養状態 ,  *RNA【核酸】 ,  植物組織 ,  cDNA ,  *構造形成 ,  相互作用 ,  多重化 ,  子嚢菌類
準シソーラス用語： 同時検出 ,  微生物多様性 ,  アンプリコン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： コケ植物 ,  エンドファイト ,  真菌群集 ,  メタトランスクリプト ,  コケ-真菌相互作用 ,  マイコビオーム ,  腐生菌 ,  共生生物

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (9件)： RNA ,  分析 ,  コケ ,  老化 ,  勾配 ,  真菌 ,  群集 ,  推定 ,  栄養