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J-GLOBAL ID：201802266650637949   整理番号：18A1733291

3種類のリンゴの重要なブドウのDNAバーコード遺伝子の選別【JST・京大機械翻訳】

Screening DNA Barcode of Three Pathogenic Fungi within Genus Botryosphaeria in Apple

著者 (6件)： Chen Zhan (南京農業大学生命科学学院,南京,210001) ,  Chen Hong (南京農業大学生命科学学院,南京,210001) ,  Xu Pingping (南京出入境検験検疫局,南京,210011) ,  Wang Zhenhua (湖北出入境検験検疫局,武漢,430050) ,  Wu Cuiping (江蘇出入境検験検疫局,南京,210019) ,  Li Bin (江蘇出入境検験検疫局,南京,210019)
資料名： Hubei Nongye Kexue  (Hubei Nongye Kexue)
巻： 57  号： 2  ページ： 126-131  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2087A  ISSN： 0439-8114  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： Botryosphaeriaは,多くの果実の腐敗を引き起こす重要な病原菌であり,形態的に区別しにくい。4つのDNA断片(ITS,LSU,SSU,EF-1α)を,BotryosphaeriastevensiiとBotryosphaeriadothideaとして選んだ。Botryosphaeriaobtusaの候補バーコードはPCR増幅、Sangerシークエンシングと配列分析を行う。その結果,PCR増幅の成功率はITS>SSU>LSU=EF-1αであり,ITSのPCR増幅の成功率は100%であった。配列分析により、ITSとEF-1α遺伝子の配列が保存され、種間の差が顕著であり、しかもB.dothidea菌種はEF-1α遺伝子中に100bp程度の特異的断片が存在し、この菌株を特異的に区別できるが、リボソーム遺伝子LSUとSSUの種間、および、遺伝子の種類が異なっていることが分かった。種内に明らかな差はない。GenBankでのブドウ属菌類のITS配列の系統発生分析により、3種類のブドウ球菌属菌株はそれぞれ3つの独立した分枝にあり、分析結果は形態鑑定の結果と一致した。ITSとEF-1αの2つの遺伝子を用いて、この3種類のブドウ属真菌のバーコードとして推薦した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *バーコード ,  ぶどう球菌属 ,  *遺伝子 ,  PCR法 ,  真菌類 ,  *ブドウ
準シソーラス用語： 鑑定 ,  系統解析 ,  ITS配列 ,  GenBank ,  菌株 ,  配列解析 ,  起因菌 ,  Botryosphaeria ,  DNAバーコード , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (5件)： リンゴ ,  ブドウ ,  DNAバーコード ,  遺伝子 ,  選別