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J-GLOBAL ID：201802267019292112   整理番号：18A0607932

毛皮の皮膚におけるcircRNA関連ceRNAネットワークの包括的circRNA発現プロファイルと施工【Powered by NICT】

Comprehensive circRNA expression profile and construction of circRNA-associated ceRNA network in fur skin

著者 (8件)： Zhu Zhiwei (College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, China) ,  Li Yuan (College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, China) ,  Liu Wenyan (College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, China) ,  He Junping (College of Animal Science and Technology, Shanxi Agricultural University, Taigu, China) ,  Zhang Lihuan (College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, China) ,  Li Huifeng (College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, China) ,  Li Pengfei (College of Life Sciences, Shanxi Agricultural University, Taigu, China) ,  Lv Lihua (College of Animal Science and Technology, Shanxi Agricultural University, Taigu, China)
資料名： Experimental Dermatology  (Experimental Dermatology)
巻： 27  号： 3  ページ： 251-257  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2573A  ISSN： 0906-6705  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非コードRNAのクラス,環状RNA(circRNA)は腫瘍形成に関連していることをRNAの新しい群である。各種疾患におけるcircRNAsの役割は既に注目されている。しかし,皮膚におけるメラニン細胞に関連したcircRNAsの発現レベルと機能はほとんど理解されていない。RNA配列は異なる分化段階中の黒fur皮膚と白苔皮膚におけるcircRNAsの発現プロファイルを解析し,関連する代謝機構を調べるために行った。差次的に発現したcircRNAsは経験的Bayes配列決定(EBSeq)を用いて検出し,定量的リアルタイムPCR法により検証した。circRNAsのEQSeq分析は黒色fur皮膚と白苔皮膚だけでなく,出生後段階における21のダウンレギュレートと17のアップレギュレートcircRNAはいにおける11ダウンレギュレーションと32アップレギュレートcircRNAsを同定した。circRNAマイクロRNA(miRNA)-メッセンジャーRNA(mRNA)ネットワークはcircRNA標的を予測するために確立した。遺伝子オントロジー(GO)解析とKyoto Encyclopediaof Genes and Genomes(KEGG)の経路分析を適用してさらにmRNAデータを濃縮した。結果は,特にGO:0042802,GO:0005080とGO:0032403,転写関連GOに関与する主に特異的m RNAは転写調節におけるそれらの特異的作用を発揮することを示した。circRNA miRNA mRNAネットワークでは,mRNAの最も濃縮されたGO用語は色素沈着,蛋白質自己りん酸化と蛋白質複合体であった。circRNA miRNA mRNA経路は色素沈着のための新しい機構を明らかにするかもしれない,circRNAsは色素沈着の候補として役立つ可能性がある。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： タンパク質複合体 ,  腫瘤形成 ,  *RNA【核酸】 ,  *ネットワーク ,  タンパク質 ,  代謝 ,  分化 ,  ダウンレギュレーション ,  mRNA
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  転写調節 ,  遺伝子オントロジー ,  定量的リアルタイムPCR法 ,  *遺伝子発現プロファイリング ,  *環状RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ceRNA ,  circRNA ,  発現 ,  ネットワーク ,  皮膚

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： 毛皮 ,  皮膚 ,  circRNA ,  ceRNA ,  発現プロファイル ,  施工