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J-GLOBAL ID：201802267054317485   整理番号：18A0405844

励起状態ab initio動力学による時間分解周波数領域で明らかにされた緑色蛍光蛋白質プロトンシャトルの機構【Powered by NICT】

The mechanism of a green fluorescent protein proton shuttle unveiled in the time-resolved frequency domain by excited state ab initio dynamics

著者 (4件)： Donati Greta (Dipartimento di Scienze Chimiche, Universita di Napoli ‘Federico II’, Complesso Universitario di M.S.Angelo, via Cintia, I-80126 Napoli, Italy. [e-mail]) ,  Petrone Alessio ,  Caruso Pasquale ,  Rega Nadia
資料名： Chemical Science (Web)  (Chemical Science (Web))
巻： 9  号： 5  ページ： 1126-1135  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7042A  ISSN： 2041-6539  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 励起状態ab initio動力学による緑色蛍光蛋白質における励起状態プロトン移動をシミュレートし,時間と多重解像度ウェーブレット解析による周波数領域の両方における反応機構を検討した。この独創的な方法は,初めて,光活性化振動の傾向を比較フェムト秒誘導Raman分光法結果に直接,反応を促進する低周波数モードが果たす役割の明確な解釈を与えることを可能にした。反応の主駆動力に起因する発色団の環-環配向運動の重要な光誘起軟化し,水素結合ネットワークの締付と反応経路の開口を可能にした。も発色団(その環間二面角とフェノールC-OおよびイミダゾリノンC-N結合距離の点で)とそのポケット(発色団ポケットの分子間酸素の二面角の点で)緩和が,ネットワークの酸素原子を含む低周波数(約120cm~ 1)モードにより調節されることを見出した。これは時間-周波数領域におけるフェムト秒Raman分光法結果と一致した。さらに,Franck-Condon領域に近接した速度はピコ秒時間スケールを含み,His148のようなすぐ近くの水素結合残基の変動からの顕著な影響を示した。アプローチは光反応性と高度な時間分解分光法の結果を理解するために,通常使用されているツールとしてab initioシミュレーションと新しいシナリオを開くものである。Copyright 2018 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 核間距離 ,  時間分解分光法 ,  酸素 ,  LF【周波数】 ,  Raman分光法 ,  ネットワーク ,  ピコ秒 ,  水素結合 ,  発色団 ,  *緑色蛍光タンパク質 ,  フェムト秒 ,  二面角 ,  プロトン移動 ,  *周波数領域 ,  *励起状態

分類 (3件)： 光化学一般  (CB08010U) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (7件)： 励起状態 ,  動力学 ,  分解 ,  周波数領域 ,  緑色蛍光蛋白質 ,  プロトン ,  シャトル