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J-GLOBAL ID：201802267081823930   整理番号：18A1296447

アンガス-ブラーマン交雑ウシ集団における集団構造とゲノム品種構成【JST・京大機械翻訳】

Population Structure and Genomic Breed Composition in an Angus-Brahman Crossbred Cattle Population

著者 (3件)： Gobena Mesfin (Department of Animal Sciences, University of Florida) ,  Elzo Mauricio A. (Department of Animal Sciences, University of Florida) ,  Mateescu Raluca G. (Department of Animal Sciences, University of Florida)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 9  ページ： 90  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 交雑育種は,牛肉生産を強化するために熱帯および亜熱帯地域で使用される一般的な戦略であり,交雑育種計画の成功にとって品種組成の正確な知識を持つことが必須である。家系記録は交雑ウシの品種組成を得るために追加的に使用されているが,家系ベースの品種組成の精度は不正確かつ/または不完全な記録とメンデルサンプリングによって減少することができる。ゲノムデータからの品種組成推定は,欠落,不完全または不正確な記録に影響されることなく,より高い精度を含む複数の利点を有し,育種された牛肉製品における品種の独立した認証として使用される能力がある。本研究は遺伝子型と家系情報を有する676のAngus-Brahman交雑ウシを用いて行い,品種組成を決定するためにゲノムデータを用いることの実現可能性と精度を評価した。著者らは,パラメータおよび非パラメトリック法におけるゲノムデータを用いて,密接な家族関係の交絡効果を説明しながら,品種組成の違いによる個体群構造を検出した。主成分分析(PCA)とADMIXTUREの最大尤度法をゲノムデータに適用することにより,不均一な品種祖先から生じる個体群構造の特性化に成功したが,密接な家族関係を説明した。PCA結果は,遺伝的変異構造化の異なる階層へのさらなる洞察を提供した。第一主成分は,Angus-Brahman比率と強く相関し,第二は,これらのウシにおける遺伝的変異の明確なパターンの存在を示す比較的拡張されたGrangus系統を持つ動物内での変動を示した。家系と遺伝的情報から推定された品種比率の間には強い一致があったが,これらの2つの方法の間には,ある種の動物に対して有意差があった。これは品種組成の家系ベースの推定における不正確さに起因する可能性が最も高く,これは品種組成を推定するときの系統的情報を補完し/または代替するためのゲノム情報を用いる場合を支持した。訓練集合として純粋に使用される教師つき分析との比較は,正確な予測が純粋な人口情報がない場合でも達成できることを示唆している。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  *品種 ,  亜熱帯 ,  キャラクタリゼーション ,  最尤法 ,  *交雑 ,  交雑育種 ,  *ゲノム ,  熱帯 ,  主成分分析 ,  動物 ,  遺伝 ,  牛肉 ,  家系
準シソーラス用語： *アンガス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 人口構造 ,  ゲノム品種構成 ,  ウシ ,  アンガス ,  ブラーマン

分類 (2件)： 飼育動物の育種  (FD01020R) ,  牛  (FD02020Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： アンガス ,  ブラーマン ,  交雑ウシ ,  集団 ,  集団構造 ,  ゲノム ,  品種構成