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J-GLOBAL ID：201802267137791814   整理番号：18A1346209

魚類胃腸微生物相からの抗菌ペプチドの高スループット同定【JST・京大機械翻訳】

High Throughput Identification of Antimicrobial Peptides from Fish Gastrointestinal Microbiota

著者 (7件)： Dong Bo (BGI Education Center, University of Chinese Academy of Sciences, Shenzhen 518083, China) ,  Yi Yunhai (BGI Education Center, University of Chinese Academy of Sciences, Shenzhen 518083, China) ,  Yi Yunhai (Shenzhen Key Lab of Marine Genomics, Guangdong Provincial Key Lab of Molecular Breeding in Marine Economic Animals, BGI Academy of Marine Sciences, BGI Marine, BGI, Shenzhen 518083, China) ,  Liang Lifeng (BGI Education Center, University of Chinese Academy of Sciences, Shenzhen 518083, China) ,  Shi Qiong (BGI Education Center, University of Chinese Academy of Sciences, Shenzhen 518083, China) ,  Shi Qiong (Shenzhen Key Lab of Marine Genomics, Guangdong Provincial Key Lab of Molecular Breeding in Marine Economic Animals, BGI Academy of Marine Sciences, BGI Marine, BGI, Shenzhen 518083, China) ,  Shi Qiong (Laboratory of Aquatic Genomics, College of Life Sciences and Oceanography, Shenzhen University, Shenzhen 518060, China)
資料名： Toxins (Web)  (Toxins (Web))
巻： 9  号： 9  ページ： 266  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7286A  ISSN： 2072-6651  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 抗微生物ペプチド(AMP)は小さなペプチドのグループであり,それは自然界においてほとんどすべての性質によって分泌される。それらは多くの細菌に対して毒性があるので,治療的および農業的側面において調査されている。ソウギョ(Ctenopharyngodon idellus)の消化管(GI)微生物の16Sとメタゲノミクスの分析においてかなりの量の研究が行われている。しかし,これらのデータセットはまだ未利用資源である。本研究において,著者らの新しく作られたソウギョのメタゲノムからAMPを予測するための相同検索を行った。著者らは,以前に報告された細菌毒素(例えば,抗生物質およびクラスIIバクテリオシン)と高い類似性を有する5つのAMPを同定した。さらに,著者らは,ソウギョのGI微生物相における上部の豊富な属が,一般的に推定AMP生産株と一致していることを観察した。それは主にLactobacillus bacillalesからである。さらに,著者らは,ソウギョのGIに存在するこれらの推定AMP産生細菌といくつかの一般的な市販プロバイオティクス(一般的に微生物学に使用されている)の系統発生的関係を構築し,それらが密接に関連することを示した。したがって,これらの株は新しい微生物学に発展する可能性がある。言い換えると,著者らは魚GI微生物相からAMPを発見するためのハイスループットな方法を提供する。それは,微生物学またはプロバイオティックサプリメントのための代替病原体拮抗剤(毒素)として開発されることができる。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *微生物 ,  *ペプチド ,  系統発生 ,  乳酸桿菌属 ,  *ミクロフローラ ,  病原体 ,  ソウギョ ,  バクテリオシン ,  細菌毒素 ,  治療法 ,  微生物学 ,  サプリメント ,  プロバイオティクス
準シソーラス用語： *抗菌ペプチド ,  メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 抗菌ペプチド(AMP) ,  魚類胃腸微生物相 ,  高スループット同定 ,  AMP産生細菌

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

引用文献 (42件)：

• Rodney, H.P.; Takeshi, Z.; Kenji, S. Novel bacteriocins from lactic acid bacteria (LAB): Various structures and applications. Microb. Cell Fact. 2014, 13 (Suppl. 1), S3.
• Zacharof, M.P.; Lovitt, R.W. Bacteriocins produced by lactic acid bacteria a review article. APCBEE Procedia 2012, 2, 50-56.
• Field, D.; Cotter, P.D.; Ross, R.P.; Hill, C. Bioengineering of the model lantibiotic nisin. Bioengineered 2015, 6, 187-192.
• Sun, Z.; Harris, H.M.; McCann, A.; Guo, C.; Argimon, S.; Zhang, W.; Yang, X.; Jeffery, I.B.; Cooney, J.C.; Kagawa, T.F.; et al. Expanding the biotechnology potential of lactobacilli through comparative genomics of 213 strains and associated genera. Nat. Commun. 2015, 6, 8322.
• Papagianni, M.; Anastasiadou, S. Pediocins: The bacteriocins of Pediococci. Sources, production, properties and applications. Microb. Cell Fact. 2009, 8, 3.

タイトルに関連する用語 (5件)： 魚類 ,  微生物相 ,  抗菌ペプチド ,  高スループット ,  同定