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J-GLOBAL ID:201802267568561499   整理番号:18A1130684

廃水処理施設における広範な抗生物質耐性遺伝子の存在量,多様性および変異の調査【JST・京大機械翻訳】

Exploring abundance, diversity and variation of a widespread antibiotic resistance gene in wastewater treatment plants
著者 (14件):
資料名:
巻: 117  ページ: 186-195  発行年: 2018年 
JST資料番号: A0646B  ISSN: 0160-4120  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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最新の1遺伝子配列データベースを構築し,新しい退化プライマーを設計し,廃水処理施設(WWTPs)からの活性スラッジにおけるPCRベース法により,ユビキタス抗生物質耐性遺伝子,sul1の豊度,多様性,および変動をより良く研究した。新しく設計された縮退プライマーは,以前のsul1プライマーと比較して,in silico評価と活性スラッジ試料の両方において高い特異性と高い被覆率を示した。新しいプライマーを用いて,夏と冬における5つのWWTPsからの活性スラッジにおける16S rRNA遺伝子と共に,sul1遺伝子の豊度と多様性を定量的PCRとMiSeq配列決定によって測定した。sul1遺伝子は一般的であり,全試料を通して全細菌に匹敵する豊度(細菌細胞当たり0.081コピー)を示した。しかし,WWTPsにおける細菌群集の量と多様性における有意な季節的および地理的多様性と比較して,ほとんどの場合におけるsul1遺伝子の代表的クラスタの有意な季節的または地理的変異はなかった。さらに,代表的なsul1クラスターは,かなり近い系統発生を示し,sul1遺伝子と優性細菌属の間に明らかな相関はなく,sul1遺伝子の細菌宿主は安定でなく,sl1遺伝子は移動性遺伝要素によって運ばれる可能性があり,時々クラス1インテグロンと統合されている可能性があることを示唆した。したがって,移動性遺伝要素は,WWTPsにおけるsul1遺伝子の組成を決定する際に,特定の微生物分類群よりも大きな役割を果たしている可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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