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J-GLOBAL ID：201802267707291507   整理番号：18A1248399

中国,上海における結核の内部移動と伝播動態:疫学的,空間的,ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Internal migration and transmission dynamics of tuberculosis in Shanghai, China: an epidemiological, spatial, genomic analysis

著者 (18件)： Yang Chongguang (Department of Epidemiology of Microbial Diseases, Yale School of Public Health, Yale University, New Haven, CT, USA) ,  Yang Chongguang (Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, School of Basic Medical Sciences, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Lu Liping (Department of Tuberculosis Control, Songjiang District Center for Disease Control and Prevention, Shanghai, China) ,  Warren Joshua L (Department of Biostatistics, Yale School of Public Health, Yale University, New Haven, CT, USA) ,  Wu Jie (Department of Tuberculosis Control, Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention, Shanghai, China) ,  Jiang Qi (Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, School of Basic Medical Sciences, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Zuo Tianyu (Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, School of Basic Medical Sciences, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Gan Mingyu (Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, School of Basic Medical Sciences, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Liu Mei (Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, School of Basic Medical Sciences, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Liu Qingyun (Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, School of Basic Medical Sciences, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  DeRiemer Kathryn (School of Medicine, University of California, Davis, Davis, CA, USA) ,  Hong Jianjun (Department of Tuberculosis Control, Songjiang District Center for Disease Control and Prevention, Shanghai, China) ,  Shen Xin (Department of Tuberculosis Control, Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention, Shanghai, China) ,  Colijn Caroline (Department of Mathematics, Imperial College London, London, UK) ,  Guo Xiaoqin (Department of Tuberculosis Control, Songjiang District Center for Disease Control and Prevention, Shanghai, China) ,  Gao Qian (Key Laboratory of Medical Molecular Virology, Ministry of Education and Health, School of Basic Medical Sciences, Shanghai Public Health Clinical Center, Fudan University, Shanghai, China) ,  Gao Qian (Shenzhen Center for Chronic Disease Control, Shenzhen, China) ,  Cohen Ted (Department of Epidemiology of Microbial Diseases, Yale School of Public Health, Yale University, New Haven, CT, USA)
資料名： Lancet Infectious Diseases  (Lancet Infectious Diseases)
巻： 18  号： 7  ページ： 788-795  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3107A  ISSN： 1473-3099  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 農村から都市域への大量の内部移動は,中国における結核制御に対する新しい挑戦をもたらす。著者らは,多数の移住者を有する都市環境における結核の動態を記述するために,ゲノム,空間および疫学的データを組み合わせることを目的とした。著者らは,上海における培養陽性Mycobacterium tuberculosis分離株の集団に基づく研究を行った。著者らは,全ゲノム配列決定を用いて,同一の可変数タンデム反復(VNTR)パターンを共有するM結核の見かけの遺伝的クラスタを識別し,居住の近接性とゲノム的にクラスタ化されたM結核のリスクの間の関係を分析した。最後に,移動者と居住者の間の感染と伝達リンクの時間を推定するために,ゲノム,空間,および疫学データを使用した。Jan1,2009,およびDec31,2015年の間に,培養陽性結核の1620症例が記録され,そのうち1211(75%)が内部移住者の間で発生した。同一VNTRパターンを共有する218人のうち150人(69%)は,少なくとも1つの他の株の10個の一塩基多型(SNP)内の分離株を有し,M結核の最近の伝達と一致した。近い近接性で生きている個体から集められた株の対は,患者の家庭間の距離のあらゆる付加的なkmに対して遠く生活する個人からのものよりも遺伝的に類似している可能性があり,遺伝子型に適合した株は約10%減少した(OR0=89[95%CI0,87~0の91];p<0)。著者らは,住民から移住者への伝達が移住者から居住者への伝達として一般的に起こり,ゲノムクラスタにおける移住者の2/3以上が移動後に局所的に感染すると推定した。都市中心における結核の局所的発生を駆動する主要な機構は,移住者と居住者の間の局所的な伝達である。疫学的,ゲノム的および空間的データの組み合わせ分析は,局所的な伝達動力学のより豊富な理解に貢献し,より効果的な介入の設計を知らせるべきである。中国の国家自然科学基金,中国の国家科学と技術Majorプロジェクト,米国国立衛生研究所。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結核菌 ,  一塩基多型 ,  住民 ,  *結核 ,  クラスタ化 ,  *ゲノム ,  培養 ,  都市 ,  遺伝子型 ,  *疫学 ,  クラスタ ,  患者 ,  遺伝
準シソーラス用語： 近接性 ,  移民 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  疫学  (GB03000E)

タイトルに関連する用語 (6件)： 中国 ,  上海 ,  結核 ,  伝播 ,  疫学 ,  ゲノム解析