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J-GLOBAL ID：201802268149962017   整理番号：18A0965833

ゲノムワイド関連研究はアメリカブナ(Fagus grandifolia Erh.)におけるブナ樹皮病抵抗性の主要遺伝子を同定する【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide association study identifies a major gene for beech bark disease resistance in American beech ( Fagus grandifolia Ehrh.)

著者 (7件)： Calic Irina (Department of Plant Sciences, University of California, Davis, USA) ,  Koch Jennifer (USDA Forest Service, Northern Research Station, Forestry Sciences Laboratory, Delaware, USA) ,  Carey David (USDA Forest Service, Northern Research Station, Forestry Sciences Laboratory, Delaware, USA) ,  Addo-Quaye Charles (Department of Horticulture and Landscape Architecture, Purdue University, Indiana, USA) ,  Addo-Quaye Charles (Present address: Division of Natural Sciences and Mathematics, Lewis-Clark State College, Lewiston, USA) ,  Carlson John E. (Schatz Center for Tree Molecular Genetics, Department of Ecosystem Science and Management, Pennsylvania State University, University Park, USA) ,  Neale David B. (Department of Plant Sciences, University of California, Davis, USA)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 547  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】北米に固有のアメリカのBeech木(Fagus grandis Ehrh)は生態学的に重要であり,高品質の木材製品を提供する。この種はブナ樹皮病(BBD)に感受性であり,北米において高い死亡率に直面している。この病害は,真菌類Neonectria(N.faginataまたはN.dictissima)の2種の1つ,およびAmerican Beech樹木の1つである,ウーolブナ(Cryptococcus fagisuga)の間の相互作用から生じる。【方法】この症例対照ゲノムワイド関連研究(GWAS)において,著者らはAffymetrix Axiom1.5K-50K分析を用いて16Kの高品質SNPを試験し,514人の個人の関連集団を遺伝子型にした。また,115個体の全同胞ファミリーにおける連鎖解析を行った。Fisherの正確な試験とロジスティック回帰試験を行い,SNPと表現型の間の関連を試験した。【結果】協会試験は,Fagus sylvaticaにおけるメタロチオネイン様蛋白質(金属イオン結合)に対するmRNAをコードする単一遺伝子(Mt)に対する染色体(Chr)5上の4つの高度に有意なSNPを明らかにした。メタロチオネインは金属原子を配位することができるCysに富む金属キレート剤を代表し,ブナ鱗昆虫に対する耐性機構において重要な役割を果たす可能性がある。【結論】GWAS研究は,ブナ樹皮病耐性に寄与する主要な影響の単一遺伝子座を同定した。抵抗性に寄与するこの遺伝的遺伝子座の知識は,適用された育種,保存および回復プログラムにおいて使用される可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  相互作用 ,  *アメリカ合衆国 ,  生態学 ,  *遺伝 ,  メタロチオネイン ,  表現型 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  昆虫類 ,  *樹皮 ,  感受性 ,  金属イオン ,  *遺伝子 ,  mRNA ,  真菌類

著者キーワード (4件)： ブナ樹皮病 ,  関連マッピング ,  耐性遺伝子 ,  アメリカのブナ

分類 (2件)： 菌類による植物病害  (FC04052Y) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (62件)：

• Fowells HA. American beech (Fagus grandifolia Ehrh.). In Silvics of Forest Trees of the United States, Agriculture Handbook No.271. Washington DC, US: Dept. Agric. Forest Service; 1965. p. 172-180.
• Fagus grandifolia Ehrh. American beech, Fagaceae beech family; Silvics of North America, vol. 2 hardwoods. Agriculture handbook 654, Vol. 2; CH Tubbs, DR Houston; U.S. Department of Agriculture, Forest Service; 1990; 325; CR2;
• 5 Fagaceae trees; Genome mapping and molecular breeding in plants, volume 7, Forest trees; A Kremer, M Casasoli, T Barreneche, C Bodénès, P Sisco; Springer-Verlag; 2007; 162-187; CR3;
• Genome; Genome size and base composition of seven Quercus species: inter- and intra-population variation; V Zoldos, D Papes, SC Brown, O Panaud, S Siljak-Yakovlev; 4; 1998; 162-168; 10.1139/gen-41-2-162; CR4;
• Beech bark disease: the oldest “new” threat to American beech in the United States. Outlooks on Pest management; JL Koch; 2010; CR5;

タイトルに関連する用語 (9件)： ゲノム ,  研究 ,  アメリカブナ ,  Fagus ,  ブナ ,  樹皮 ,  抵抗性 ,  遺伝子 ,  同定