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J-GLOBAL ID：201802268222407862   整理番号：18A0975133

3D単一粒子追跡を用いた結合事象検出の精度【JST・京大機械翻訳】

Accuracy of the detection of binding events using 3D single particle tracking

著者 (3件)： Carozza Sara (Huygens-Kamerlingh Onnes Laboratory, Leiden University, Leiden, Netherlands) ,  Culkin Jamie (Huygens-Kamerlingh Onnes Laboratory, Leiden University, Leiden, Netherlands) ,  Noort John van (Huygens-Kamerlingh Onnes Laboratory, Leiden University, Leiden, Netherlands)
資料名： BMC Biophysics (Web)  (BMC Biophysics (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 3  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7272A  ISSN： 2046-1682  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ナノ粒子は,生きている細胞の中の単一蛋白質のような生体分子の位置を追跡するための標識として使用することができる。蛋白質の活性は付着粒子の移動度の変化から時々推定できる。平均二乗変位解析は,拡散係数Dのような追跡粒子の軌跡から移動度情報を得るための最も一般的な方法である。しかし,Dの精度は,拡散に固有の確率を反映する変化からの生物学的事象によって引き起こされる移動度の変化を識別する限界を設定する。この問題は,動的プロセスの定量化を目的とした実験において特に重要である。【結果】Here,著者らは,拡散係数を抽出するための最良の分析パラメータを確立するために,グリセロール溶液中で自由に拡散する金ナノロッドによるシミュレーションおよび3D追跡実験を提示した。この知識を拡散の一時的変化の検出に適用した。それは,粒子の細胞内の移動構造への過渡的結合により起こり,このイベントの拡散と持続時間の変化の大きさへの依存性を試験した。結論:シミュレーションは,粒子追跡の空間精度が一般的に短い結合イベントの検出を制限しないことを示した。このようなイベントの正確な定量化には,拡散の変化の大きさと結合イベント当たりのフレーム数の注意深い解析が必要である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 継続時間 ,  移動度 ,  付着 ,  *三次元 ,  タンパク質 ,  ナノ粒子 ,  拡散係数 ,  軌跡 ,  脂肪族アルコール ,  ポリオール
準シソーラス用語： *粒子追跡 ,  金ナノロッド ,  平均二乗変位 ,  生体分子 ,  *イベント検出 ,  *単一粒子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 単一粒子追跡 ,  拡散 ,  結合事象 ,  平均二乗変位解析

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  コロイド化学一般  (CB11010C)

物質索引 (1件)： グリセロール

引用文献 (30件)：

• Appl Phys Lett; Nanometric three-dimensional tracking of individual quantum dots in cells; L Holtzer, T Meckel, T Schmidt; 90; 5; 2007; 053902; 10.1063/1.2437066; CR1;
• Biophys J; Detection of non-Brownian diffusion in the cell membrane in single molecule tracking; K Ritchie, XY Shan, J Kondo, K Iwasawa, T Fujiwara, A Kusumi; 88; 3; 2005; 2266-77; 10.1529/biophysj.104.054106; CR2;
• J Cell Biol; Translational diffusion of macromolecule-sized solutes in cytoplasm and nucleus; O Seksek, J Biwersi, AS Verkman; 138; 1; 1997; 131-42; 10.1083/jcb.138.1.131; CR3;
• Biophys J; Single-particle tracking: the distribution of diffusion coefficients; MJ Saxton; 72; 4; 1997; 1744-53; 10.1016/S0006-3495(97)78820-9; CR4;
• Annu Rev Biophys Biomol Struct; Single-particle tracking:Applications to membrane dynamics; MJ Saxton, K Jacobson; 26; 1997; 373-99; 10.1146/annurev.biophys.26.1.373; CR5;

タイトルに関連する用語 (4件)： 3D ,  単一粒子 ,  追跡 ,  事象検出