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J-GLOBAL ID：201802268315664640   整理番号：18A0975748

共有遺伝子の一意性に基づく疾患類似性マトリックス【JST・京大機械翻訳】

A disease similarity matrix based on the uniqueness of shared genes

著者 (8件)： Carson Matthew B. (Department of Preventive Medicine, Feinberg School of Medicine, Northwestern University, Chicago, USA) ,  Liu Cong (Department of Bioengineering, University of Illinois at Chicago, Chicago, USA) ,  Liu Cong (Center for Biomedical Informatics, Shanghai Children’s Hospital, Shanghai, China) ,  Lu Yao (Center for Biomedical Informatics, Shanghai Children’s Hospital, Shanghai, China) ,  Jia Caiyan (Department of Computer Science, Beijing Jiaotong University, Beijing, China) ,  Lu Hui (Department of Bioengineering, University of Illinois at Chicago, Chicago, USA) ,  Lu Hui (Center for Biomedical Informatics, Shanghai Children’s Hospital, Shanghai, China) ,  Lu Hui (SJTU-Yale Joint Center for Biostatistics, Department of Bioinformatics and Biostatistics, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China)
資料名： BMC Medical Genomics (Web)  (BMC Medical Genomics (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 26  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7308A  ISSN： 1755-8794  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:複合疾患は多くの遺伝子を含み,これらの遺伝子はしばしばいくつかの異なる疾患と関連している。疾患類似性測定は,共有遺伝子型または表現型に基づくことができる。遺伝子間の関係を定量化することにより,以前に知られていない結合を明らかにすることができ,治療開発と薬物浄化のための参照基盤を形成できる。【方法】著者らは,共有された遺伝子の一意性を組み込んだ疾患類似性を測定する方法を紹介する。各疾患対に対して,OMIMと疾患オントロジーアノテーションを用いて,一意性スコアを計算し,疾患類似性マトリックスを構築した。【結果】疾患オントロジーベースのマトリックスを用いて,著者らの知見をサポートするための研究とともに,癌と他の疾患の間のいくつかの興味ある接続とマラリアなどの条件を同定した。著者らはまた,文献支援がほとんどないか否かのいくつかの高いスコアリング対関係を見出し,さらなる研究を保証する潜在的に興味深い接続を強調した。結論:OMIMとDORIFデータからの疾患の間の関係を調べるために,遺伝子独自性に基づく共起マトリックスを開発した。著者らの類似性マトリックスは,潜在的な疾患関係を同定し,疾患における因果的機構を研究するさらなる研究を動機づけるために使用できる。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *類似性 ,  治療法 ,  遺伝子型 ,  表現型 ,  *遺伝子 ,  *一意性 ,  マラリア
準シソーラス用語： スコア化 ,  スコア ,  類似性測定 ,  複合病 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 疾患-疾患類似性 ,  疾患関連遺伝子 ,  クラスタリング

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (26件)：

• J Theor Biol; Multiclass classification of sarcomas using pathway based feature selection method; JL Gu, Y Lu, C Liu, H Lu; 362; 2014; 3-8; 10.1016/j.jtbi.2014.06.038; CR1;
• Liu C, Xu J, Chen Y, Guo X, Zheng Y, et al. Characterization of genome-wide H3K27ac profiles reveals a distinct PM2.5-associated histone modification signature. Environ Health. 2015;14:65. doi:10.1186/s12940-015-0052-5..
• Gene Regul Syst Bio; Inference of cancer-specific gene regulatory networks using soft computing rules; X Wang, O Gotoh; 4; 2010; 19-34; 10.4137/GRSB.S4509; CR3;
• Int J Cancer; A three-gene panel that distinguishes benign from malignant thyroid nodules; B Zheng, J Liu, J Gu, Y Lu, W Zhang; 136; 2015; 1646-1654; 10.1002/ijc.29172; CR4;
• BMC Syst Biol; Meta-analysis of sex differences in gene expression in schizophrenia; W Qin, C Liu, M Sodhi, H Lu; 10; Suppl 1; 2016; 9; 10.1186/s12918-015-0250-3; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 共有 ,  遺伝子 ,  一意性 ,  疾患 ,  類似性 ,  マトリックス