文献

J-GLOBAL ID：201802268646172224   整理番号：18A0621725

既存血転写分類器は南インドからの患者における潜伏感染からの活動性結核を正確に区別【Powered by NICT】

Existing blood transcriptional classifiers accurately discriminate active tuberculosis from latent infection in individuals from south India

著者 (14件)： Leong Samantha (Centre for Emerging Pathogens, Department of Medicine, Rutgers-New Jersey Medical School, Newark, NJ, USA) ,  Zhao Yue (Division of Computational Biomedicine, Boston University School of Medicine and Bioinformatics Program, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Joseph Noyal M. (Jawaharlal Institute of Postgraduate Medical Education and Research, Pondicherry, India) ,  Hochberg Natasha S. (Boston Medical Centre, Boston, MA, USA) ,  Hochberg Natasha S. (Boston University, School of Public Health, Boston, MA, USA) ,  Sarkar Sonali (Jawaharlal Institute of Postgraduate Medical Education and Research, Pondicherry, India) ,  Pleskunas Jane (Boston Medical Centre, Boston, MA, USA) ,  Hom David (Boston Medical Centre, Boston, MA, USA) ,  Lakshminarayanan Subitha (Jawaharlal Institute of Postgraduate Medical Education and Research, Pondicherry, India) ,  Horsburgh C. Robert (Boston University, School of Public Health, Boston, MA, USA) ,  Roy Gautam (Jawaharlal Institute of Postgraduate Medical Education and Research, Pondicherry, India) ,  Ellner Jerrold J. (Boston Medical Centre, Boston, MA, USA) ,  Johnson W. Evan (Division of Computational Biomedicine, Boston University School of Medicine and Bioinformatics Program, Boston University, Boston, MA, USA) ,  Salgame Padmini (Centre for Emerging Pathogens, Department of Medicine, Rutgers-New Jersey Medical School, Newark, NJ, USA)
資料名： Tuberculosis  (Tuberculosis)
巻： 109  ページ： 41-51  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3216A  ISSN： 1472-9792  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： いくつかの研究は,潜伏結核(TB)からの活性区別できる血液トランスクリプトーム特性を同定した。本研究の目的は,これらの既存の遺伝子プロファイルは,南インド人集団における結核疾患を分類するか評価することであった。RNA配列決定は28例のTB患者から採取した全血PAXgene試料で実行され,16潜伏結核感染(LTBI)は,進行中の家族の接触研究の一部として登録した。差次的遺伝子発現とクラスタリング解析は,確立された遺伝子サインに基づくTB及びLTBI個体の明確な予測試験と比較した。既知遺伝子セットの発現(ROC AUC 0.9007 0.9879)を基礎にして結核疾患状態の強い予測性能を観察した。まとめると,著者らの知見は,異なる民族集団から発生した以前に報告された分類器は,南インド人患者におけるLTBIから活動性TBを正確に識別できることを示した。今後の研究は,診断のための普遍的なTB遺伝子シグネチャー既存遺伝子サイン変換,TB治療を監視し,新しい薬物療法を評価することに焦点を当てるべきである。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 予測 ,  トランスクリプトーム ,  遺伝子 ,  民族 ,  *患者 ,  薬物療法 ,  *結核 ,  *潜伏感染 ,  クラスタ化 ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 差次的遺伝子発現 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  潜伏結核 ,  *活動性結核 ,  *南インド , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 結核 ,  癌のバイオマーカーバイオマーカー ,  遺伝子シグネチャー ,  診断

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  感染症・寄生虫症の診断  (GD01020S)

タイトルに関連する用語 (7件)： 血 ,  転写 ,  分類器 ,  南インド ,  患者 ,  潜伏感染 ,  活動性結核