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J-GLOBAL ID：201802268832239185   整理番号：18A0787023

Veillonella parvulaの外膜プロテオーム ヒトミクロビオームの二つの二枚葉【JST・京大機械翻訳】

Outer Membrane Proteome of Veillonella parvula: A Diderm Firmicute of the Human Microbiome

著者 (8件)： Poppleton Daniel I. (Unite de Biologie Moleculaire du Gene chez les Extremophiles, Departement de Microbiologie, Institut Pasteur) ,  Duchateau Magalie (Unite de Spectrometrie de Masse Structurale et Proteomique, Plateforme Proteomique, Department de Biologie Structurale et Chime, Institut Pasteur, USR 2000 Centre National de la Recherche Scientifique) ,  Hourdel Veronique (Unite de Spectrometrie de Masse Structurale et Proteomique, Plateforme Proteomique, Department de Biologie Structurale et Chime, Institut Pasteur, USR 2000 Centre National de la Recherche Scientifique) ,  Matondo Mariette (Unite de Spectrometrie de Masse Structurale et Proteomique, Plateforme Proteomique, Department de Biologie Structurale et Chime, Institut Pasteur, USR 2000 Centre National de la Recherche Scientifique) ,  Flechsler Jennifer (Pflanzliche Entwicklungsbiologie und Elektronenmikroskopie, Department I. Botanik, Biozentrum der LMU Muenchen) ,  Klingl Andreas (Pflanzliche Entwicklungsbiologie und Elektronenmikroskopie, Department I. Botanik, Biozentrum der LMU Muenchen) ,  Beloin Christophe (Unite de Genetique des Biofilms, Departement de Microbiologie, Institut Pasteur) ,  Gribaldo Simonetta (Unite de Biologie Moleculaire du Gene chez les Extremophiles, Departement de Microbiologie, Institut Pasteur)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1215  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Veillonella parvulaは,ヒトの肺,ちつ,口および胃腸管において見出される生物膜形成性共生であるが,日和見病原体に発達する可能性がある。さらに,Veillonellaの存在は乳児における健康な免疫系の発達と関連している。Veillonella属は進化的謎を代表する細菌の多様なクレードであるNegativicutesに属している:それらは系統発生的にグラム陽性(単胚葉)Firmicutesに属するが,古典的グラム陰性(二胚葉)細菌に類似したリポ多糖類を持つ外膜(OM)を維持する。NegativicutesのOMsは,OmpMによるBraunのリポ蛋白質の置換を含むユニークな特性を有し,OMをペプチドグリカンに繋留する。系統的ゲノム解析を通して,著者らは最近,Negativicutes di胚葉細胞エンベロープの生物情報学的注釈を提供した。著者らは,それが現在のFirmicutesの祖先に存在するユニークなタイプのエンベロープであり,この門において独立して複数の時間を失い,単胚葉構造を引き起こすことを示した。しかしながら,ほとんどの実験データは,現在,いかなるネガチビカートセルエンベロープに対しても利用可能ではない。ここでは,V.parvulaのOMプロテオームを生産する,二枚葉Firmicutesの細胞エンベロープの最初の実験的プロテオーム特性化を行った。著者らは最初に,12の異なる局在化予測プログラムを用いて,V.parvula DSM 2008のゲノムからの全1844の予測された蛋白質の完全な生物情報学的分析を行った。これらの結果は,表面露出(SE)蛋白質タグによる蛋白質抽出と細胞内分画により補完され,両者は液体クロマトグラフィータンデム質量分析により分析された。プロテオミクスとバイオインフォマティクスの結果の融合は78のOM蛋白質の同定を可能にした。これらは,OM蛋白質生合成(BamA)に対するBAM系の主成分であるTonB依存性輸送に対する多数の受容体,Lpt系成分LptDを含み,これはOMへのLPSの挿入と主要OmpM蛋白質のいくつかのコピーに関与する。V.parvulaのOMプロテオームのアノテーションは,OM蛋白質生合成に対するBAM/TAM系の実験的証拠,およびOMへのLPS輸送に対する完全なLpt系の実験的証拠を含む,Negativicutesの細胞エンベロープの性質に関する以前の推論を著しく拡張する。それはまた,O抗原合成のための可能な遺伝子クラスタおよび多数のアドヘシンのような,VeillonellaのライフスタイルにおけるOM成分の役割に関する重要な情報を提供する。最後に,多くのOM仮想蛋白質が同定され,それはさらなる特性化のための優先標的である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生合成 ,  系統発生 ,  病原体 ,  タンデム質量分析 ,  キャラクタリゼーション ,  ゲノム ,  プロテオミクス ,  *ヒト ,  *プロテオーム ,  リポ多糖類 ,  遺伝子クラスタ ,  バイオインフォマティクス ,  消化管 ,  *ベイロネラ属 ,  ファーミキューテス門 ,  *微生物
準シソーラス用語： 胃腸管 ,  *Veillonella ,  Firmicutes , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 否定者 ,  プロテオミクス ,  BAM/TAM複合体 ,  アドヘシン ,  OMPM ,  LPS ,  LPTシステム ,  O抗原

分類 (1件)： 歯の基礎医学  (GT01020O)

タイトルに関連する用語 (3件)： Veillonella ,  プロテオーム ,  葉