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J-GLOBAL ID：201802268972564578   整理番号：18A0383940

fMRIデータのモデル化生理学的雑音に対するPhysIOツールボックス【Powered by NICT】

The PhysIO Toolbox for Modeling Physiological Noise in fMRI Data

著者 (15件)： Kasper Lars (Translational Neuromodeling Unit (TNU), Institute for Biomedical Engineering, University of Zurich and ETH Zurich, Wilfriedstrasse 6, 8032 Zurich, Switzerland) ,  Kasper Lars (Institute for Biomedical Engineering, ETH Zurich and University of Zurich, Gloriastrasse 35, 8092 Zurich, Switzerland) ,  Bollmann Steffen (Centre for Advanced Imaging, University of Queensland, Brisbane, QLD, 4072, Australia) ,  Diaconescu Andreea O. (Translational Neuromodeling Unit (TNU), Institute for Biomedical Engineering, University of Zurich and ETH Zurich, Wilfriedstrasse 6, 8032 Zurich, Switzerland) ,  Hutton Chloe (Wellcome Trust Centre for Neuroimaging, University College London, London WC1N 3BG, UK) ,  Heinzle Jakob (Translational Neuromodeling Unit (TNU), Institute for Biomedical Engineering, University of Zurich and ETH Zurich, Wilfriedstrasse 6, 8032 Zurich, Switzerland) ,  Iglesias Sandra (Translational Neuromodeling Unit (TNU), Institute for Biomedical Engineering, University of Zurich and ETH Zurich, Wilfriedstrasse 6, 8032 Zurich, Switzerland) ,  Hauser Tobias U. (Wellcome Trust Centre for Neuroimaging, University College London, London WC1N 3BG, UK) ,  Hauser Tobias U. (Max Planck University College London Centre for Computational Psychiatry and Ageing Research, London WC1 B 5EH, UK) ,  Sebold Miriam (Department of Psychiatry and Psychotherapy, Campus Mitte, Charite Universitaetsmedizin, 10117 Berlin, Germany) ,  Manjaly Zina-Mary (Department of Neurology, Schulthess Clinic, 8008 Zurich, Switzerland) ,  Pruessmann Klaas P. (Institute for Biomedical Engineering, ETH Zurich and University of Zurich, Gloriastrasse 35, 8092 Zurich, Switzerland) ,  Stephan Klaas E. (Translational Neuromodeling Unit (TNU), Institute for Biomedical Engineering, University of Zurich and ETH Zurich, Wilfriedstrasse 6, 8032 Zurich, Switzerland) ,  Stephan Klaas E. (Wellcome Trust Centre for Neuroimaging, University College London, London WC1N 3BG, UK) ,  Stephan Klaas E. (Max Planck Institute for Metabolism Research, 50931 Cologne, Germany)
資料名： Journal of Neuroscience Methods  (Journal of Neuroscience Methods)
巻： 276  ページ： 56-72  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1129A  ISSN： 0165-0270  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生理学的雑音は,fMRIの主要な交絡因子の一つである。共通クラス補正の方法が末梢測定から雑音をモデル化し,ECGまたは空気圧ベルトのような。しかし,生理的ノイズ補正は,fMRIデータのための標準的な前処理段階はまだによるものとして出現していない(1)生理学的記録のデータ品質,(2)非標準周辺データフォーマットと(3)処理とモデリング生理学の完全自動化,大規模コホート研究に必要なが不足している。生理学的記録とモデルベース雑音補正の前処理のためのPhysIOツールボックスを導入した。は様々な雑音モデルを実装し,RETROICOR,時間当たりの呼吸量と心拍変動応答(RVT/HRV)である。ツールボックスは,手動の介入なしに全ての中間段階データフォーマットの柔軟な読み込みからGLM回帰/コントラスト生成へをカバーしている。ツールボックスのワークフローと異なるベンダ,記録デバイス,電界強度と課題個体群からのデータセットのためのその機能性を実証した。生理的雑音補正と性能評価の自動化は群研究で報告されている(N=35)。PhysIOツールボックスは先に行った雑音モデルの生理的ノイズパターンと補正効果を再現した。生理学的サイクルの売主 提供ピーク検出法をによるモデル化ロバスト性を増加させた。最後に,ツールボックスは,完全自動化,性能監視を含む,入力データに関して柔軟性を統合したフレームワークを提供する。プラットフォーム独立なMatlab実装,オープンソース分布,およびモジュール構造を通して,PhysIOツールボックスは生理的ノイズ補正をするfMRIデータのためのアクセス可能な前処理ステップである。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： ロバスト性 ,  コントラスト ,  前処理 ,  データフォーマット ,  性能評価 ,  *モデリング ,  *雑音 ,  柔軟性 ,  自動化 ,  モジュール構造 ,  *生理学 ,  ワークフロー
準シソーラス用語： MATLAB ,  *ツールキット ,  *機能的MRI , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 生理的雑音補正 ,  fMRI ,  RETROICOR ,  RVHRCOR ,  心拍数 ,  呼吸量 ,  SPMツールボックス ,  fMRI前処理

分類 (2件)： 医用画像処理  (JE04020T) ,  生体計測  (EL03020C)

タイトルに関連する用語 (5件)： fMRI ,  モデル化 ,  生理学 ,  雑音 ,  ツールボックス