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J-GLOBAL ID：201802269079784708   整理番号：18A0325543

X.laevisの蛋白質をコードする遺伝子の遺伝的多様性へのトランスクリプトーム洞察【Powered by NICT】

Transcriptomic insights into genetic diversity of protein-coding genes in X. laevis

著者 (7件)： Savova Virginia (Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Pearl Esther J. (National Xenopus Resource and Bell Center for Regenerative Biology and Tissue Engineering, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02543, USA) ,  Boke Elvan (Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Nag Anwesha (Dana-Farber Cancer Institute and Department of Genetics, Harvard Medical School, 450 Brookline Ave., Boston, MA 02215, USA) ,  Adzhubei Ivan (Division of Genetics, Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Horb Marko E. (National Xenopus Resource and Bell Center for Regenerative Biology and Tissue Engineering, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA 02543, USA) ,  Peshkin Leonid (Department of Systems Biology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA)
資料名： Developmental Biology  (Developmental Biology)
巻： 424  号： 2  ページ： 181-188  発行年： 2017年 
JST資料番号： C0522A  ISSN： 0012-1606  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA-seqデータと対立遺伝子特異的解析を用いたXenopus laevis(アフリカツメガエル)株の遺伝的多様性を特性化した。このデータは符号化変化,ゲノム配列を改善するために用いられることができるのと同様に,良好な配列アラインメント,プローブ設計,及びプロテオミクス分析のためのカタログを提供する。添加では,十分に確立された予測ツール(PolyPhen 2)を用いた異なるクラスの突然変異をアノテーション機能による種の遺伝的景観の広い像を描いた。さらに,四交雑:近交系ゲノム(J)-ひずみ,非近交系アルビノ(B)-歪,およびJとB株の二ハイブリッド交雑の子孫における変化を比較した。B株,この異質四倍体における重複遺伝子に影響を及ぼす選択圧を調べることができ,特異的変異のサブセットを同定した。これらの交雑から,同義変異に対する非同義の比は重複遺伝子,これらが高い純化淘汰下にあることを示唆し低い見出した。驚いたことに,著者らはまた機能変化(「損傷」)変異は,このグループにおける非同義変異体の大きな分率,重複遺伝子に影響する符号化変化における潜在的機能分化の役割を示唆することを構成することを見出した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *遺伝 ,  突然変異 ,  *トランスクリプトーム ,  対立遺伝子 ,  交雑 ,  符号化 ,  アフリカツメガエル ,  *遺伝子 ,  変異 ,  *タンパク質 ,  ゲノム
準シソーラス用語： サイレント変異 ,  オーバーラップ遺伝子 ,  近交系 ,  ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 発生と分化  (EJ16020W)

タイトルに関連する用語 (5件)： 蛋白質 ,  遺伝子 ,  遺伝的多様性 ,  トランスクリプトーム ,  洞察