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J-GLOBAL ID：201802269378866090   整理番号：18A0691072

16S rRNAの高スループット配列決定に基づく糖尿病性骨髄炎感染骨組織における病原微生物の分析【JST・京大機械翻訳】

Pathogen analysis in patients with diabetic foot osteomyelitis using 16S rRNA high-throughput sequencing

著者 (8件)： Hu Ping (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515) ,  Zou Mengchen (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515) ,  Cao Ying (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515) ,  Pan Yanling (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515) ,  Luo Xiangrong (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515) ,  Jiang Ya (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515) ,  Xue Yaoming (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515) ,  Gao Fang (南方医科大学南方医院内分泌代謝科,广東 广州,510515)
資料名： Nanfang Yike Daxue Xuebao  (Nanfang Yike Daxue Xuebao)
巻： 37  号： 11  ページ： 1448-1455  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2216A  ISSN： 1673-4254  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:16S rRNAハイスループットシークエンシング技術を用いて、糖尿病性足関節炎(DFO)感染骨組織中の病原微生物の特徴を分析し、臨床感染病原菌の同定及び治療に迅速、正確な方法を提供する。方法:2016年9月から2017年4月にかけて、当科で入院した16例のDFO患者の創傷手術中に得られた感染骨標本を採取し、それぞれ16s rRNAハイスループットシークエンシング技術と血液培養分析器を用いて病原微生物の同定を行った。16S rRNA配列決定結果におけるDFOの細菌群の特徴を分析し、培養結果と比較した。結果:16s rRNAシークエンシングにより、DFO骨組織の病原微生物の多様性は比較的に大きく、分布は比較的均一で、優勢菌属は20種で、すべての属の87.00%を占め、そのうちPrevotellaは豊度が最も大きい属であることが分かった。2つの同定法の結果は,DFO病原菌がグラム陰性菌であることを示した。培養法と比較して,16S rRNA配列の陽性率は高く(100%対88.24%),各病原体の平均数は12.56 vs 1.50であり,グラム陰性菌の割合は高かった(67.16%対50.00%)。さらに,16s rRNA配列決定の結果は,Escherichia coli,Serratia marcescensおよびEnterobacter cloacaを除いたすべての培養病原菌の結果をカバーしていることが示された。さらに,13種の細菌属は培養結果には存在しないことが示されたが,それらの間には存在しなかった。これらの中で,Anaerococcus,Veillonella,Bacteroides,Fusarium,Porphyromonas,Finegoldia,Prevotella,Peptostreptococcus,Parvimonas,PeptoniphilusおよびBulleidiaは,嫌気性菌または嫌気性菌であった。しかし,培養結果において,嫌気性菌の出現はなかった。しかし、培養結果により、DFOにおける多剤耐性菌の割合は58.33%に達することが示された。【結論】16S rRNAの高スループット配列は,DFO骨組織における微生物の多様性と豊度を示し,DFO骨組織の病原微生物多様性は大きく,分布は均一であるが,優勢菌属は分布がなく,グラム陰性菌が主である。培養法と比較して、16s rRNAシークエンシングは病原菌の鑑定に対して簡単で正確であり、特にグラム陰性菌と嫌気性菌の同定において顕著な優位性があり、迅速かつ正確にDFO感染治療を指導できる。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *rRNA ,  *糖尿病 ,  治療法 ,  Prevotella ,  患者 ,  *微生物 ,  *感染 ,  病原体 ,  嫌気性菌 ,  培養 ,  グラム陰性菌
準シソーラス用語： 配列解析 ,  起因菌 ,  *病原微生物 ,  *骨組織 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： diabetic foot osteomyelitis ,  16S rRNA gene ,  high-throughput sequencing ,  culture ,  pathogens

分類 (3件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： rRNA ,  高スループット ,  糖尿病 ,  骨髄炎 ,  感染 ,  骨組織 ,  病原微生物 ,  分析