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J-GLOBAL ID：201802269536452432   整理番号：18A1578908

マイクロRNA発現スペクトルに基づく甲状腺髄様癌の鍵調節微小RNAスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Screening of key regulatory microRNAs in medullary thyroid carcinoma based on microRNA expression chips

著者 (5件)： Li Guoqing (河南省人民医院甲状腺外科,鄭州,450003) ,  Ding Chao (河南省人民医院甲状腺外科,鄭州,450003) ,  Sun Wencong (河南省人民医院甲状腺外科,鄭州,450003) ,  Zhang Ji (河南省人民医院甲状腺外科,鄭州,450003) ,  Su Zijie (河南省人民医院甲状腺外科,鄭州,450003)
資料名： Zhonghua Shiyan Waike Zazhi  (Zhonghua Shiyan Waike Zazhi)
巻： 35  号： 6  ページ： 1133-1136  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2337A  ISSN： 1001-9030  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:バイオインフォマティクス分析を通じて、40例の甲状腺髄様癌患者の癌組織と癌周辺組織の微小RNA(miRNAs、miR)発現スペクトルの変化を観察し、疾患関連の重点miRNAs及びその標的遺伝子を探す。方法GeneExpressionOmnibus(GEO)から甲状腺髄様癌患者の遺伝子発現データ表現チップ原始データGSE40807をダウンロードした。まず、2種類のサンプルの差次的発現miRNAを比較し、データベースを用いてmiRNAのターゲット遺伝子を予測し、その後、これらの標的遺伝子の機能及び参与する代謝経路を分析し、ターゲット遺伝子間の相互作用ネットワーク及び標的遺伝子と転写因子の調節ネットワークを構築した。結果:正常甲状腺と比較し、甲状腺髄様癌において、21個のmiRNAs発現が明らかに変化し、そのうち18個のmiRNAs発現が上方制御され、3個のmiRNAsが下方制御された。11の予測ターゲット遺伝子データベースを用いて336のmiRNA-ターゲット遺伝子関係を得て、これらのターゲット遺伝子に対してSTRINGタンパク質の相互作用ネットワーク分析を行い、230のノードと491の関係対を得た。さらに、これらの標的遺伝子に対してTF予測と調節ネットワークを構築し、7つの転写因子、156のノードと300の関係樹を得た。【結語】甲状腺髄様癌のmiRNA発現プロファイルおよび関連標的遺伝子を,生物情報法により系統的に分析し,miR-124,miR-7およびmiR-129-5を,甲状腺髄様癌の関連調節因子としてスクリーニングした。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アップレギュレーション ,  転写因子 ,  *甲状腺 ,  ダウンレギュレーション ,  予測 ,  *スクリーニング ,  相互作用 ,  データベース ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  ネットワーク
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Medullary thyroid carcinoma ,  Target genes ,  MicroRNA chip

分類 (2件)： 内分泌系の腫よう  (GL04000P) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (9件)： マイクロRNA ,  発現 ,  スペクトル ,  甲状腺髄様癌 ,  鍵 ,  調節 ,  微小 ,  RNA ,  スクリーニング