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J-GLOBAL ID：201802269552105661   整理番号：18A2228593

遺伝子調節領域の進化的計算とモジュール構成【JST・京大機械翻訳】

Evolutionary Computations and Modular Organization of the Gene Regulatory Regions

著者 (2件)： Spirov Alexander (I. M. Sechenov Institute of Evolutionary, Physiology and Biochemistry RAS, St. Petersburg, Russia) ,  Myasnikova Ekaterina (I. M. Sechenov Institute of Evolutionary, Physiology and Biochemistry RAS, St. Petersburg, Russia)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2018  号： BGRS¥SB  ページ： 94-99  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子調節領域(プロモーターとエンハンサー)のモジュール構成は,遺伝子機能と進化の理解に重要である。進化生物学からのアイデアと概念に触発された進化論の分野において,進化的探索効率のための理論的基礎に特別な注意を払った。これらは,この地域に対する基礎を置いた,スキーマ定理と建築ブロック仮説(J.Hollandによる)である。理論をさらに発展させるために,Royal Road関数(RRFs)を導入し,包括的に研究した。ここでは,指向性分子進化(SELEXなど)におけるRRF実装として扱うことができるモジュール遺伝子調節領域のいくつかの事例研究を考察した。異なる数学的場からの解析ツールは,RRFクラスの問題に対する探索動力学の詳細で定量的な記述を開発するために,共研究者によるvan Nimwegenに対する可能性を与えた。このアプローチは,理論的に良く理解されているRRFのようなベンチマーク事例からの進化計算を,試験管におけるより効率的な指向性分子進化の基礎として役立つ生物学的事例に橋渡しする。RRF上で良く機能する交差演算子を導入することにより,細菌プロモーターのための実際の設計問題を扱うための計算技術を開発している。特に,レトロウイルスまたは「性」PCR組換えのように働く交差演算子を導入した。このアルゴリズムは標準ECよりも実質的に高い進化探索の有効性を達成できることを見出した。ECからの計算理論は,実際の遺伝子構造が進化し,プロモーターと他の遺伝子調節要素の指向性進化に関する実験室研究を高速化することを理解するのに寄与できる。Copyright 2019 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データ構造 ,  分子進化 ,  レトロウイルス科 ,  *遺伝的調節 ,  プロモーター領域 ,  *遺伝子 ,  アルゴリズム ,  指向性 ,  ベンチマーク ,  有効性 ,  事例研究 ,  *調節遺伝子 ,  高速化 ,  細菌
準シソーラス用語： 進化論 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (4件)： 遺伝子 ,  調節領域 ,  進化的計算 ,  モジュール