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J-GLOBAL ID：201802269681182889   整理番号：18A0212621

バラ根系AMF 18S rRNA遺伝子クローンライブラリーの構築と分析【JST・京大機械翻訳】

Construction and Analysis of AMF 18S rRNA Gene Clone Library in‘Rosa Carola’Roots

著者 (8件)： Ren Zhen (昆明学院農学院/云南省高等学校都市型現代農業工程研究中心,云南昆明,650214) ,  Yin Min (云南大学医学院,云南昆明,650091) ,  Xia Tiyuan (昆明学院農学院/云南省高等学校都市型現代農業工程研究中心,云南昆明,650214) ,  Chen Zebin (昆明学院農学院/云南省高等学校都市型現代農業工程研究中心,云南昆明,650214) ,  Yin Lifang (昆明学院農学院/云南省高等学校都市型現代農業工程研究中心,云南昆明,650214) ,  Han Li (昆明学院農学院/云南省高等学校都市型現代農業工程研究中心,云南昆明,650214) ,  Jin Song (昆明学院農学院/云南省高等学校都市型現代農業工程研究中心,云南昆明,650214) ,  Wang Dingkang (昆明学院農学院/云南省高等学校都市型現代農業工程研究中心,云南昆明,650214)
資料名： Xinan Nongye Xuebao  (Xinan Nongye Xuebao)
巻： 30  号： 9  ページ： 2113-2118  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3020A  ISSN： 1001-4829  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]本論文では、バラ根系のAMFの多様性と組成構造について研究した。[方法]昆明の生殖質資源の圃場からランダムにバラのカラスラの3株を採集し、CTAB法により根系DNAを抽出し、ネステッドPCRを用いてAM真菌部分18S rRNA遺伝子領域を増幅し、増幅産物を混合した後にクローンライブラリーを構築し、最終的に30個の陽性クローン配列を確定した。また,ライブラリーの評価と分析を行った。[結果]ライブラリーのCoverage C値は80%であったが,Rarefaction曲線は飽和しないので,ライブラリーのクローン数を増加させる必要があることが示された。Shannon多様性指数とShannon指数は,それぞれ1.432と0.25であり,種の豊富さは4.0であった。98%を境とし、30本の配列は15個のOTUに分けられ、いずれもGlomusの種類である。OTU1はライブラリにおける主なタイプであり,OTU2~OTU9は一般的な型を示し,OTU10~OTU15はまれなタイプであった。10個のOTUは系統樹において単独でクラスタ化され、Glomusの比較的新しい種類を代表している。【結論】15のOTUは,Glomusの種であり,それらの中で,主なタイプは,1つのタイプ,8つの一般的タイプ,6つのまれなタイプ,そして,それらの分類は,明確でなかった。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ化 ,  *遺伝子 ,  *クローン ,  Glomus ,  DNA【核酸】 ,  真菌類 ,  *根系 ,  系統樹
準シソーラス用語： 種豊富度 ,  多様性指数 ,  アンプリコン ,  生殖質 ,  *クローンライブラリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Rosa Carola ,  AMF ,  Clone library ,  Phylogenetic tree ,  Evaluation and analysis

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (7件)： バラ ,  根系 ,  AMF ,  rRNA遺伝子 ,  クローンライブラリー ,  構築 ,  分析