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J-GLOBAL ID：201802269757587914   整理番号：18A0653830

塩と乾燥ストレス下におけるポプラの新しい内生遺伝子のスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Selection of Novel Reference Genes in Poplar under Salt and Drought Stresses

著者 (6件)： Chu Wenyuan (安徽農業大学林学与園林学院 合肥 230036) ,  Wang Yujiao (安徽農業大学林学与園林学院 合肥 230036) ,  Zhu Dongyue (安徽農業大学林学与園林学院 合肥 230036) ,  Chen Zhu (安徽農業大学林学与園林学院 合肥 230036) ,  Yan Hanwei (安徽農業大学林学与園林学院 合肥 230036;安徽農業大学作物抗逆育種与減災国家地方聯合工程実験室 合肥 230036) ,  Xiang Yan (安徽農業大学林学与園林学院 合肥 230036;安徽農業大学作物抗逆育種与減災国家地方聯合工程実験室 合肥 230036)
資料名： Linye Kexue  (Linye Kexue)
巻： 53  号： 10  ページ： 70-79  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2424A  ISSN： 1001-7488  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]ポプラの複数の遺伝子チップのデータにより、塩と乾燥ストレス下で安定的に発現できる遺伝子をポプラの新たな内部遺伝子としてスクリーニングし、より安定で、より理想的な内参遺伝子を発掘するための方法を提供する。[方法]公表された遺伝子チップデータベースを用いて、異なる生長時期、異なるストレス処理下のポプラの発現データを取得し、これらのデータを正規化処理し、遺伝子の異なる試験条件下における発現量の安定性に対して順序付けを行った。遺伝子の機能注釈情報を結合し、新しい内参遺伝子をスクリーニングする。遺伝子発現の安定性をさらに検証するために,NaCl,PEGにより処理された南林95ポプラ(組織培養苗)の葉身材料を研究対象とし,リアルタイム蛍光定量PCR法を用いて,以下の結果を得た。6つの伝統的な参照遺伝子(PtUKN1,PtUBQ,Actin,EF1α,18S rRNA,TUA8)と本研究でスクリーニングした6つの新規遺伝子の処理後の0,1,4,8,12,24時間における遺伝子発現量を分析することにより,6つの新しい遺伝子を同定し,以下の結果を得た。また、geNorm、NormFinderとBestKeeper内の遺伝子分析ソフトを用いて、試験データを統計と順位付けし、これら12個の遺伝子の発現安定性を比較し、適切な内参遺伝子をスクリーニングした。[結果]6つの安定した発現の新しい内生遺伝子(PtRG1,PtRG2,PtRG3,PtRG4,PtRG5,PtRG6)をスクリーニングした。これら6つの新しい内部遺伝子を6つの伝統的な内因性遺伝子と比較した後に,PtRG2とPtRG3の安定性はより高く,乾燥ストレス下でのPtRG3とPtRG5の安定性はより良かった。NormFinderプログラムにおける塩ストレス下では,TUA8とPtRG1の安定性はより良く,乾燥ストレス下では,PtRG1とPtRG2の安定性はより良かった。BestKeeperプログラムにおいて,PtRG1およびPtRG5の安定性は,塩ストレス下でより良好であり,乾燥ストレス下では,PtRG3およびPtRG5の安定性は,より良好であった。以上の3つの内生遺伝子分析ソフトの結果を総合すると、PtRG1、PtRG3とPtRG5の安定性は比較的に良い。新しい内部標準遺伝子の信頼性を更に検証するために、NaClとPEG処理条件下で誘導発現されたPtVQ6、PtVQ13とPtVQ37を対照として蛍光定量PCR試験を行った。3つのVQ遺伝子の全体的な発現傾向は,他の参照遺伝子を用いた結果と一致していることが分かった。[結論]本研究で同定されたPtRG1,PtRG3およびPtRG5は,塩および乾燥ストレス下のポプラにおける内部標準遺伝子として適しており,これらの新規遺伝子のマイニングは,リアルタイム蛍光定量PCR試験における標的遺伝子の発現レベルを正確に修正するために重要である。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 信頼性 ,  データベース ,  正規化 ,  蛍光 ,  定量的PCR法 ,  *スクリーニング ,  *遺伝子 ,  塩化ナトリウム ,  *ハコヤナギ属 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  塩分ストレス ,  遺伝子解析 ,  参照遺伝子 ,  *乾燥ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： poplar ,  quantitative real-time PCR ,  reference genes ,  salt stress ,  drought stress

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 塩 ,  乾燥ストレス ,  ポプラ ,  遺伝子 ,  スクリーニング