文献

J-GLOBAL ID：201802269852833306   整理番号：18A1031889

宿主レベルでのインフルエンザ相互作用のエージェントベースモデルシミュレーション:肺炎球菌感染のインフルエンザ関連負担への洞察【JST・京大機械翻訳】

An agent-based model simulation of influenza interactions at the host level: insight into the influenza-related burden of pneumococcal infections

著者 (5件)： Arduin Helene (Biostatistics, Biomathematics, Pharmacoepidemiology and Infectious Diseases, UMR1181 - Universite de Versailles Saint Quentin en Yvelines, Inserm, Institut Pasteur, Paris Cedex 15, France) ,  Celles Matthieu Domenech de (Biostatistics, Biomathematics, Pharmacoepidemiology and Infectious Diseases, UMR1181 - Universite de Versailles Saint Quentin en Yvelines, Inserm, Institut Pasteur, Paris Cedex 15, France) ,  Guillemot Didier (Biostatistics, Biomathematics, Pharmacoepidemiology and Infectious Diseases, UMR1181 - Universite de Versailles Saint Quentin en Yvelines, Inserm, Institut Pasteur, Paris Cedex 15, France) ,  Watier Laurence (Biostatistics, Biomathematics, Pharmacoepidemiology and Infectious Diseases, UMR1181 - Universite de Versailles Saint Quentin en Yvelines, Inserm, Institut Pasteur, Paris Cedex 15, France) ,  Opatowski Lulla (Biostatistics, Biomathematics, Pharmacoepidemiology and Infectious Diseases, UMR1181 - Universite de Versailles Saint Quentin en Yvelines, Inserm, Institut Pasteur, Paris Cedex 15, France)
資料名： BMC Infectious Diseases (Web)  (BMC Infectious Diseases (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 382  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7430A  ISSN： 1471-2334  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:宿主レベルのインフルエンザウイルス-呼吸器相互作用はしばしば報告されている。関与する正確な生物学的機構は解明されていないが,二次細菌感染は,季節的およびパンデミック発生の間,インフルエンザ関連負荷の大部分を占めることが知られている。これらの相互作用はおそらく微生物の伝達動力学とインフルエンザ公衆衛生料金に影響する。数学モデルは,インフルエンザ流行と制御対策の公衆衛生影響を調べるために広く使われてきた。しかしながら,ほとんどのインフルエンザモデルは相互作用現象を見落とし,他の共循環病原体を無視した。【方法】Hereinにおいて,著者らは他の呼吸器病原体との相互作用の間のインフルエンザ伝達の新規なエージェントベースのモデル(ABM)を記述する。相互作用している微生物は,個体群(流行型,例えば呼吸性細菌)において持続することができるか,または短期的な年間発生(流行型,例えば冬の呼吸器ウイルス)を引き起こすことができる。エージェントベースのフレームワークは,病原体の自然史と複雑なホスト内現象の正確な形式化を可能にする。事例研究として,このABMを,いくつかの生物学的機構が提案されている良く知られたインフルエンザウイルス-肺炎球菌相互作用に適用した。相互作用の異なる機構的仮説をシミュレートし,得られたウイルス誘導肺炎球菌感染(PI)負荷を評価した。【結果】このABMは,PI症例の毎週発生率,保菌率,流行の大きさおよび流行時期に関して,両病原体に対する現実的なデータを生成する。特に,異なる相互作用仮説は異なる透過パターンをもたらし,関連PI負荷の広い変動をもたらした。相互作用強度も最も重要であった:インフルエンザが肺炎球菌獲得を増加させたとき,インフルエンザシーズンの間のPI負荷の4~27%は,相互作用強度に依存してインフルエンザに起因した。結論:このオープンソースABMは,理論的観点からインフルエンザ相互作用を調査する新しい機会を提供し,他の病原体に容易に拡張することができた。これは,異なるシナリオに対するin silicoデータを生成するためのユニークな枠組みを提供し,それにより機構的仮説を試験する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 干渉 ,  事例研究 ,  *シミュレーション ,  個体群 ,  呼吸器 ,  *インフルエンザ ,  インフルエンザウイルス ,  病原体 ,  *相互作用 ,  数学モデル ,  公衆衛生 ,  *肺炎球菌 ,  細菌感染
準シソーラス用語： 保菌率 ,  発生率 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： エージェントベースモデル ,  インフルエンザ ,  病原体間相互作用 ,  干渉 ,  伝送動力学 ,  肺炎球菌 ,  シミュレーション ,  負荷 ,  数学モデル

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

引用文献 (49件)：

• World Health Organization: Influenza (Seasonal).http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs211/en(2016). Accessed 11 May 2017.
• Bosch AATM, Biesbroek G, Trzcinski K, Sanders EAM, Bogaert D. Viral and bacterial interactions in the upper respiratory tract. PLoS Pathog. 2013; doi:10.1371/journal.ppat.1003057.
• Rohani P, Green CJ, Mantilla-Beniers NB, Grenfell BT. Ecological interference between fatal diseases. Nature. 2003; doi:10.1038/nature01542.
• Griffiths EC, Pedersen AB, Fenton A, Petchey OL. The nature and consequences of coinfection in humans. J Inf Secur. 2011; doi:10.1016/j.jinf.2011.06.005.
• Tanner H, Boxall E, Osman H. Respiratory viral infections during the 2009-2010 winter season in Central England, UK: incidence and patterns of multiple virus co-infections. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2012; doi:10.1007/s10096-012-1653-3.

タイトルに関連する用語 (7件)： 宿主 ,  インフルエンザ ,  相互作用 ,  肺炎球菌 ,  感染 ,  負担 ,  洞察