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J-GLOBAL ID：201802270188721852   整理番号：18A0966099

高度に管理されたブタ個体群における致死的劣性変異を同定する系統的調査【JST・京大機械翻訳】

A systematic survey to identify lethal recessive variation in highly managed pig populations

著者 (7件)： Derks Martijn F. L. (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, Wageningen, The Netherlands) ,  Megens Hendrik-Jan (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, Wageningen, The Netherlands) ,  Bosse Mirte (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, Wageningen, The Netherlands) ,  Lopes Marcos S. (Topigs Norsvin Research Center, Beuningen, the Netherlands) ,  Lopes Marcos S. (Topigs Norsvin, Curitiba, Brazil) ,  Harlizius Barbara (Topigs Norsvin Research Center, Beuningen, the Netherlands) ,  Groenen Martien A. M. (Wageningen University & Research, Animal Breeding and Genomics, Wageningen, The Netherlands)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 858  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 致死的劣性変異はホモ接合子の出生前死亡を引き起こす可能性がある。個体群における低頻度で通常存在するが,個々の適応性に及ぼす影響は実質的である。最近まで,劣性胚致死的変異の存在は,減少した稔性を通して間接的に測定できた。本研究では,商業的育種会社により日常的に発生するゲノムデータの豊富さからブタにおける妊娠中の発生の初期と後期の両方に関連する遺伝的遺伝子座の存在を推定する。80K SNPチップ遺伝子型に基づいて潜在的に有害な遺伝的変異のための3つの市販ブタ(Sus scrofa)個体群を調べ,生殖形質に及ぼす影響を推定した。3つの個体群からの24000のブタは,ホモ接合ハプロタイプの欠損または減少のために分析された。ホモ接合動物の完全欠損または枯渇を伴うゲノムの145ハプロタイプ(サイズ0.5~4Mbの範囲)を同定した。35のハプロタイプは,分析された生殖形質の少なくとも1つに対して負の効果を示す(総数生まれ,死産の数,および交尾された子豚の数)。特に1つの変異体は胎児の発生の相対的後期停止をもたらし,それらが妊娠中期に死亡するので,観察された死産子ブタ(’mummies’)の有意な割合の原因となると思われた。さらに,この現象の基礎となる可能性のある候補として,BMPR遺伝子を同定した。著者らの研究は,致死的な劣性変異が存在するが,これらの対立遺伝子の頻度はこれらの高度に管理された個体群において常に低いことを示している。それにもかかわらず,有害変異体の累積効果により,多数の影響を受けた子孫が生産される。さらに,著者らの研究は,遺伝子機能の理解を増加させることができる「自然ノックアウト」を系統的にスクリーニングするための大規模な商業的遺伝的実験の使用を実証する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 適応性 ,  遺伝子型 ,  遺伝 ,  ハプロタイプ ,  *劣性 ,  対立遺伝子 ,  *個体群 ,  育種 ,  妊娠 ,  ゲノム ,  胎児 ,  *変異
準シソーラス用語： 死産 ,  ホモ接合 ,  遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 集団ゲノミクス ,  遺伝学 ,  有害な変動 ,  胚の致死性 ,  ミイラ化子ブタ

分類 (5件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  呼吸器の疾患  (GI03000Z) ,  豚  (FD02040U) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

引用文献 (43件)：

• Nat Rev Genet; The genetics of inbreeding depression; D Charlesworth, JH Willis; 10; 11; 2009; 783-796; 10.1038/nrg2664; citation_id=CR1
• J Anim Sci; Consequences of selection for improving production traits on the frequency of deleterious alleles for fitness; JF Kearney, P Navarro, CS Haley, B Villanueva; 87; 3; 2009; 850-859; 10.2527/jas.2008-1099; citation_id=CR2
• Genome Res; NGS-based reverse genetic screen for common embryonic lethal mutations compromising fertility in livestock; C Charlier, W Li, C Harland, M Littlejohn, W Coppieters, F Creagh, S Davis, T Druet, P Faux, F Guillaume; 26; 10; 2016; 1333-1341; 10.1101/gr.207076.116; citation_id=CR3
• Mol Ecol; Untangling the hybrid nature of modern pig genomes: a mosaic derived from biogeographically distinct and highly divergent Sus Scrofa populations; M Bosse, HJ Megens, O Madsen, LA Frantz, Y Paudel, RP Crooijmans, MA Groenen; 23; 16; 2014; 4089-4102; 10.1111/mec.12807; citation_id=CR4
• J Anim Sci; Genetic gain and economic values of selection strategies including semen traits in three- and four-way crossbreeding systems for swine production; D Gonzalez-Pena, RV Knox, MD MacNeil, SL Rodriguez-Zas; 93; 3; 2015; 879-891; 10.2527/jas.2014-8035; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： ブタ ,  個体群 ,  劣性 ,  変異 ,  同定 ,  系統 ,  調査