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J-GLOBAL ID：201802270213429683   整理番号：18A1642290

Los Alamos国立研究所からの4つのHIV-1主要サブタイプのNefにおける正に選択された変異の同定と特性化【JST・京大機械翻訳】

Identification and Characterization of Positively Selected Mutations in Nef of Four HIV-1 Major Subtypes from Los Alamos National Laboratory

著者 (4件)： Shadabi Elnaz (Department of Medical Microbiology, University of Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada) ,  Liang Binhua (JC Wilt Infectious Disease Research Centre, National Microbiology Laboratory, Public Health Agency of Canada, Winnipeg, Manitoba, Canada) ,  Plummer Frank (Department of Medical Microbiology, University of Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada) ,  Luo Ma (Department of Medical Microbiology, University of Manitoba, Winnipeg, Manitoba, Canada)
資料名： Current HIV Research  (Current HIV Research)
巻： 16  号： 2  ページ： 130-142  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3593A  ISSN： 1570-162X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ヒト免疫不全ウイルス-1(HIV-1)は,宿主免疫圧を回避するために急速に突然変異する。これにより,ウイルスゲノム全体を通して正選択突然変異(PSM)の発生が生じた。ウイルス病原性において重要な役割を果たすHIV-1の付属蛋白質の1つであるNefにおける逃避突然変異は,いくつかの大規模コホート研究において以前に同定されているが,種々のHIV-1サブタイプにおけるPSM過剰時間の進化は不明のままである。【方法】:161クレードA1,3093クレードB,647クレードCおよび115クレードD HIV-1nef配列を,Los Alamos国立研究所のHIVデータベースから得て,MEGA6.0を用いて整列した。各クレードからの配列を収集の年に基づいて分類した。擬似分析を用いてPSMを同定し,PSMsの数と位置を異なるサブタイプ間で比較した。結果:全ての4つのサブタイプに対するPSMはNefの配列にわたって分布し,保存された残基F90,W113,PxxPxR(a.a72-77)は不変の過時間を維持した。PSMsの頻度はサブタイプB配列間で安定であったが,他のサブタイプでは過剰時間を増加した。系統発生分析により,PSMを含む配列は,サブタイプレベルとサブタイプレベルの両方でクラスタ化する傾向があることを示した。結論:PSMsの同定とHIV-1の種々のサブタイプ内のそれらの変化は,治療戦略を設計するための洞察を提供できるグローバルなウイルス進化パターンの定義において重要である。Copyright 2018 Bentham Science Publishers All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ化 ,  突然変異 ,  治療計画 ,  タンパク質 ,  高速度 ,  *キャラクタリゼーション ,  *変異 ,  データベース ,  *HIV1
準シソーラス用語： ウイルス進化 ,  系統解析 ,  残基 ,  クレード ,  ウイルスゲノム ,  *サブタイプ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： HIV-1 Nef ,  サブタイプ ,  正の選択 ,  進化 ,  PSMS ,  突然変異

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (8件)： LOS ,  研究所 ,  HIV-1 ,  サブ ,  タイプ ,  変異 ,  同定 ,  特性化