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J-GLOBAL ID：201802270223427193   整理番号：18A0624444

DNA配列における反復ヌクレオチドの検出【Powered by NICT】

Detection of repetitive nucleotides in DNA sequences

著者 (1件)： Nauli Tigor (Research Center for Informatics, Indonesian Institute of Sciences, Bandung, Indonesia)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2017  号： ICITech  ページ： 1-5  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの反復要素はゲノムに豊富に存在した。個体を同定するためのDNAフィンガープリント法のような分子遺伝学的手法の多くの応用は,反復要素に関連している。反復要素の数を増加させると,いくつかの遺伝的疾患に関与している。反復要素の認識はゲノム解析における重要な問題である。パターンの事前知識を持つDNA配列における反復ヌクレオチドを検出しないための計算方法を提案した。反復を求めて類似したパターンマッチングにより検討した。ヌクレオチドパターンの表をDNA配列を横切るウィンドウを滑らせることにより構築した。表は,各パターンに対して,パターンは配列に位置している全ての位置を保持している。指標のリストに基づいて,領域候補は配列から導かれた。候補とDNA配列の最善の整列が領域の両端を拡張し,反復をもたらした。アルゴリズムは五種のヒト遺伝子におけるヌクレオチド反復を検出するのに良好な選択性を示した。DNA配列における反復ヌクレオチドを探索するための最も効率的な方法ではないが,アルゴリズムは容易に実装できる。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝 ,  アルゴリズム ,  *ヌクレオチド ,  ヒト ,  遺伝子 ,  DNAフィンガープリント法 ,  ゲノム ,  パターンマッチング
準シソーラス用語： 事前知識 ,  ゲノミクス ,  分子遺伝学 ,  *DNA配列 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： DNA配列 ,  反復 ,  ヌクレオチド