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J-GLOBAL ID：201802270468599027   整理番号：18A1136660

サリチル酸デカルボキシラーゼのギンコール酸生物分解,ホモロジーモデリングおよび分子動力学シミュレーションのための触媒活性【JST・京大機械翻訳】

The catalytic activity for ginkgolic acid biodegradation, homology modeling and molecular dynamic simulation of salicylic acid decarboxylase

著者 (10件)： Hu Yanying (College of Biotechnology, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, PR China) ,  Hu Yanying (Department of Life Science and Technology, Jining University, Qufu 273155, Shandong Province, PR China) ,  Hua Qingyuan (College of Biotechnology, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, PR China) ,  Sun Guojuan (College of Biotechnology, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, PR China) ,  Shi Kunpeng (College of Biotechnology, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, PR China) ,  Zhang Huitu (College of Biotechnology, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, PR China) ,  Zhao Kai (Hebei Kingsci Pharmaceutical Technology Co., Ltd, Shijiazhuang 050035, Hebei Province, PR China) ,  Jia Shiru (College of Biotechnology, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, PR China) ,  Dai Yujie (College of Biotechnology, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin 300457, PR China) ,  Wu Qingli (Department of Medicinal Chemistry, School of Environmental and Biological Sciences, Rutgers University, NJ 08901, USA)
資料名： Computational Biology and Chemistry  (Computational Biology and Chemistry)
巻： 75  ページ： 82-90  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0201B  ISSN： 1476-9271  CODEN： COCHDK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 毒性ギンコール酸はイチョウの応用に対する主要な安全性の懸念である。本研究では,ギンコール酸に対するサリチル酸デカルボキシラーゼ(SDC)の分解能力を,基質としてギンコール酸C15:1を用いて調べた。結果は,イチョウ種子におけるギンコール酸C15:1の含有量が,40°C,pH5.5でのSDCによる5時間処理後に著しく減少したことを示した。SDCの構造とSDCと基質の間の相互作用を調査するために,ホモロジーモデリング,分子ドッキングおよび分子動力学を実行した。結果はSDCがZn2+を含む触媒活性中心を持つことも示した。2,6-ジヒドロキシ安息香酸デカルボキシラーゼの鋳型構造と比較して,結合ポケット,His10,Phe23およびPhe290を囲む残基は,それぞれ,SDCの相同構築構造においてAla10,Tyr27およびTyr301により置換された。これらの違いは,サリチル酸誘導体に対するSDCの基質適応性に有意に影響する可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  毒性 ,  基質 ,  *計算機シミュレーション ,  生物活性 ,  *触媒活性 ,  イチョウ ,  安全性 ,  *分子動力学 ,  *カルボキシリアーゼ ,  結合部位 ,  芳香族カルボン酸 ,  フェノール類 ,  ヒドロキシ酸
準シソーラス用語： 分子ドッキング ,  *分子動力学シミュレーション ,  *ホモロジーモデリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： サリチル酸デカルボキシラーゼ ,  生物活性 ,  ホモロジーモデリング ,  動的シミュレーション

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

物質索引 (2件)： 2,6-ジヒドロキシ安息香酸 ,  サリチル酸

タイトルに関連する用語 (7件)： サリチル酸 ,  デカルボキシラーゼ ,  ギンコール酸 ,  生物分解 ,  ホモロジーモデリング ,  分子動力学シミュレーション ,  触媒活性