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J-GLOBAL ID：201802270631080740   整理番号：18A0673850

細胞外分泌蛋白質群の機能予測と分析【JST・京大機械翻訳】

Functional Prediction and Analysis of Agaricus Bisporus Secretome

著者 (5件)： Liu Xuying (青島農業大学食品科学与工程学院,山東青島266109;青島農業大学生命科学学院,山東青島266109) ,  Ruan Xinmei (青島農業大学食品科学与工程学院,山東青島,266109) ,  Cheng Fansheng (青島農業大学食品科学与工程学院,山東青島,266109) ,  Li Wenxiang (青島農業大学食品科学与工程学院,山東青島,266109) ,  Zhu Dan (青島農業大学生命科学学院,山東青島,266109)
資料名： Shiyong Jun Xuebao  (Shiyong Jun Xuebao)
巻： 24  号： 3  ページ： 7-12,Inside Front Cover  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2992A  ISSN： 1005-9873  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では,Agaricus bisporusの10448の蛋白質を研究した。シグナルペプチド解析ソフトウェアSignalP4.1,膜貫通構造予測ソフトウェアTMHMM v2.0,GPIアンカー位置予測ソフトウェアPer Predictor,および細胞内蛋白質局在化ソフトウェアTargetP1.1などの生物情報学ソフトウェアを用いて,この研究を行った。細胞外分泌タンパク質配列をスクリーニングし,分析ソフトウェアBLAST2GOを用いて機能的注釈を行った。469個の細胞外分泌タンパク質配列をスクリーニングし、統計により、これらのタンパク質をコードするオープンリーディングフレーム(open reading frame、ORF)は最長4800bpで、平均は1233bpであることが分かった。蛋白質を仮定すると,細胞外分泌蛋白質の生物学的代謝経路は,主に生体高分子代謝(22.2%),炭水化物代謝(17.4%),脂質代謝(3.2%),芳香族化合物代謝(2.2%)などであった。同時に、133種類の酵素類が発見され、その中には、グリコシド加水分解酵素(38.5%)、多銅オキシダーゼ(7.4%)、ペプチダーゼ(7.0%)、ペクチン分解酵素(4.0%)及びカルボン酸エステラーゼ(2.9%)などが含まれている。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 脂質代謝 ,  代謝経路 ,  *分泌タンパク質 ,  糖質代謝 ,  アノテーション ,  *外分泌 ,  アミノ酸配列 ,  *予測 ,  代謝 ,  リアーゼ ,  ソフトウェア ,  シグナルペプチド ,  カルボン酸エステラーゼ
準シソーラス用語： オープンリーディングフレーム ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Agaricus bisporus ,  extracellular protein ,  bioinformatics ,  functional annotation ,  enzymatic classification

分類 (5件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  酵素一般  (EB09010D) ,  野菜  (FC03043X) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  野菜とその加工品  (FJ11020O)

タイトルに関連する用語 (3件)： 分泌蛋白質 ,  予測 ,  分析