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J-GLOBAL ID：201802271412543216   整理番号：18A0156735

他のルーピン種のLupinus luteusL.(マメ科)および異種間拡大のためのInDelマーカーの開発と特性化【Powered by NICT】

Development and characterization of InDel markers for Lupinus luteus L. (Fabaceae) and cross-species amplification in other Lupin species

著者 (5件)： Osorio Claudia E. (Centro de Genomica Nutricional Agroacuicola, Las Heras 350, Temuco, La Araucania 4781158, Chile) ,  Udall Joshua A. (Brigham Young University, Plant and Wildlife Science Department, 150 E 1230 North, Provo, UT 84602, USA) ,  Salvo-Garrido Haroldo (Centro de Genomica Nutricional Agroacuicola, Las Heras 350, Temuco, La Araucania 4781158, Chile) ,  Maureira-Butler Ivan J. (Centro de Genomica Nutricional Agroacuicola, Las Heras 350, Temuco, La Araucania 4781158, Chile) ,  Maureira-Butler Ivan J. (Instituto de Produccion y Sanidad Vegetal, Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile)
資料名： Electronic Journal of Biotechnology  (Electronic Journal of Biotechnology)
巻： 31  ページ： 44-47  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3356A  ISSN： 0717-3458  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 強い人工的選択及び/又は天然ボトルネックを栽培種における遺伝的変異を制限するかもしれない。オーファン温帯作物,Lupinus luteusは苦味/甘味アルカロイド栽培化の歴史中の多様性減少,育種努力を制限し,分子マーカー開発困難な仕事を受けている。本研究の主な目的は,黄色ハウチワマメ遺伝学と育種を支援する新しい多型挿入-欠失(InDel)マーカーを発生させた。ゲノム減少ライブラリーと次世代シーケンシングを併用することにより,いくつかの多形InDelマーカーはin silico多型マーカー118InDelを同定したL.luteus.のために開発した。十八InDelプライマーセットは多様なL.luteusコアコレクションで評価した,遺伝子座当たり2 3対立遺伝子間の増幅された。観察された異型接合率(HO;0.0648~0.5564)と多型情報含有量(PIC;0.06~0.48)推定は,L.luteus系統の遺伝的変異の中程度レベルを明らかにした。さらに,十九InDel遺伝子座を成功裏にLupinus hispanicus Boiss&ロイト,およびLupinus mutabilis Sweet,それぞれ二L.luteus近縁種を増幅した。PCA分析は二L.luteusクラスタを同定し,最も可能性のある栽培種履歴によって説明した。InDelマーカーの開発は,L.luteus個体群を横切ると同様に,密接に関連した種間の遺伝的多様性の研究を促進するであろう。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *キャラクタリゼーション ,  農作物 ,  クラスタ ,  対立遺伝子 ,  個体群 ,  遺伝学 ,  育種 ,  栽培品種 ,  *ハウチワマメ属 ,  ゲノム
準シソーラス用語： 近縁種 ,  ヘテロ接合性 ,  分子マーカー ,  栽培化 ,  遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： 系統 ,  遺伝的多様性 ,  ゲノム還元ライブラリー ,  in silico多型マーカー ,  挿入-欠失マーカー ,  Lupinus hispanicus ,  Lupinus mutabilis ,  次世代配列決定 ,  植物栽培化

分類 (3件)： 野菜とその加工品  (FJ11020O) ,  食品製造・加工・保蔵法一般  (FJ03010M) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： ルーピン ,  Lupinus ,  マメ科 ,  拡大 ,  マーカー ,  開発 ,  特性化