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J-GLOBAL ID：201802271902422428   整理番号：18A0324235

グラミシジンAチャンネル形成局所脂質再分布IIを誘導する:3D連続体弾性モデル【Powered by NICT】

Gramicidin A Channel Formation Induces Local Lipid Redistribution II: A 3D Continuum Elastic Model

著者 (5件)： Sodt Alexander J. (Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland) ,  Beaven Andrew H. (Department of Chemistry, The University of Kansas, Lawrence, Kansas) ,  Andersen Olaf S. (Department of Physiology and Biophysics, Weill Cornell Medical College, New York, New York) ,  Im Wonpil (Department of Biological Sciences and Bioengineering Program, Lehigh University, Bethlehem, Pennsylvania) ,  Pastor Richard W. (Laboratory of Computational Biology, National Heart, Lung, and Blood Institute, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 112  号： 6  ページ： 1198-1213  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 立体配座を変えるために,蛋白質は周囲の二重層を変形しなければならない。本研究では,脂質二分子層中のグラミシジンAの三次元連続体弾性モデルは,厚さ,曲率ストレス,及び脂質二分子層の機械的性質に対する感受性を記述することを示した。三次元連続体モデルで使用できる全原子シミュレーションからのグラミシジン-脂質境界条件を抽出するための方法を提示する。境界条件は変形に劇的に影響を及ぼす,よりもはるかに材料剛性における典型的な変動は脂質組成が変化した。さらに,曲率ストレスに対する感受性を直接制御する。全原子モデルと連続体モデルの曲率応力と疎水性表面は非常に良く一致することが分かった。連続体モデルは,混合物中のチャネル近傍の疎水性整合脂質の濃縮を推定するために適用し,結果はBeavenの論文等生物物理学ジャーナルの本号におけるによる随伴論文から単一チャネル実験と拡張分子動力学シミュレーションと一致した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 境界条件 ,  計算機シミュレーション ,  *連続体 ,  感受性 ,  疎水性 ,  曲率 ,  *チャネル ,  脂質二分子膜 ,  立体配座 ,  *脂質 ,  ポリペプチド
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  *グラミシジン ,  原子論的シミュレーション ,  連続体モデル ,  *弾性モデル , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  細胞膜の輸送  (EF04020R) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

物質索引 (1件)： グラミシジンA

タイトルに関連する用語 (8件)： グラミシジンA ,  チャンネル ,  脂質 ,  再分布 ,  誘導 ,  3D ,  連続体 ,  弾性モデル