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J-GLOBAL ID：201802272176271252   整理番号：18A0276242

クラスタ化されたアフリカツメガエルケラチン遺伝子:ゲノム,トランスクリプトームおよびプロテオーム解析【Powered by NICT】

Clustered Xenopus keratin genes: A genomic, transcriptomic, and proteomic analysis

著者 (9件)： Suzuki Ken-ichi T. (Graduate School of Science, Hiroshima University, 1-3-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima 739-8526, Japan) ,  Suzuki Miyuki (Graduate School of Science, Hiroshima University, 1-3-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima 739-8526, Japan) ,  Shigeta Mitsuki (Graduate School of Science, Hiroshima University, 1-3-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima 739-8526, Japan) ,  Fortriede Joshua D. (Xenbase, Division of Developmental Biology, Cincinnati Children’s Hospital Medical Center, Cincinnati, OH 45229, USA) ,  Takahashi Shuji (Graduate School of Science, Hiroshima University, 1-3-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima 739-8526, Japan) ,  Mawaribuchi Shuuji (Kitasato Institute for Life Sciences, Kitasato University, 5-9-1 Shirokane, Minato-ku, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Yamamoto Takashi (Graduate School of Science, Hiroshima University, 1-3-1 Kagamiyama, Higashi-Hiroshima, Hiroshima 739-8526, Japan) ,  Taira Masanori (Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, The University of Tokyo, 7-3-1 Hongo, Bunkyo-ku, Tokyo 113-0033, Japan) ,  Fukui Akimasa (Laboratory of Tissue and Polymer Sciences, Faculty of Advanced Life Science, Hokkaido University, N10W8, Sapporo 060-0810, Japan)
資料名： Developmental Biology  (Developmental Biology)
巻： 426  号： 2  ページ： 384-392  発行年： 2017年 
JST資料番号： C0522A  ISSN： 0012-1606  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ケラチン遺伝子は中間径フィラメントスーパーファミリーに属し,その発現は脊椎動物の上皮細胞における形態学的および生理学的変化後に変化した。ケラチン遺伝子は二群,タイプIとIIに分かれ,脊椎動物ゲノム,Xenopus種を含むにクラスターを形成した。Xenopus laevis(アフリカツメガエル)における個体発生を通したそれらのユニークな発現パターンにより同定し,特性化した種々のケラチン遺伝子が,二Xenopus種で以前に報告されたと新たに同定されたケラチン遺伝子の編集はケラチン遺伝子の進化のさらなる理解に必要であり,両生類だけでなく全ての陸生脊椎動物である。本研究では,全部で120個の推定I型およびII型ケラチン遺伝子は二種Xenopusからゲノムデータに基づいて同定した。はこれらの遺伝子の大部分は二相同染色体,X.laevisにおけるXLA9_10とXLA2,X.tropicalisにおけるXTR10とXTR2,ヒトのそれらにオーソロガスな,テトラポッドの保存されたシンテニーを示し高度にクラスタ化したことを明らかにした。いろいろな,はい段階と成体組織からRNA-Seqデータは発達段階および組織特異的様式でオーソロガスと相同ケラチン遺伝子のユニークな発現プロファイルを明らかにした。さらに,ショットガンプロテオミクスを用いた全胚,幼虫皮膚,尾部,及び成人皮膚から数十表皮ケラチン蛋白質を同定した。我々の結果を考慮して,著者らは,放射線,多様化およびクラスター化ケラチン遺伝子のユニークな発現,両生類発生中の表皮発生と陸上適応,アフリカツメガエルスペシエーションに密接に関係して論じた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *プロテオーム ,  ヒト ,  *ケラチン ,  生理学 ,  幼虫 ,  *アフリカツメガエル ,  モルフォロジー ,  キャラクタリゼーション ,  成体 ,  RNA【核酸】 ,  *クラスタ ,  *ゲノム ,  上皮細胞 ,  *遺伝子 ,  *クラスタ化 ,  *動物タンパク質 ,  *ピパ科 ,  *改変

著者キーワード (6件)： ゲノム ,  ケラチン ,  プロテオーム ,  トランスクリプトーム ,  Xenopus laevis(アフリカツメガエル) ,  Xenopus tropicalis

分類 (1件)： 発生と分化  (EJ16020W)

タイトルに関連する用語 (5件)： クラスタ ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  トランスクリプトーム ,  プロテオーム解析