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J-GLOBAL ID：201802272430264902   整理番号：18A1522245

バイオインフォマティクスに基づく抑欝マウス長期にわたるフルオキセチン投与後の差次的遺伝子発現の解析【JST・京大機械翻訳】

Expression of hippocampal different genes in depressed mice after long-term use of fluoxetine by bioinformatic analysis

著者 (6件)： Gao Lijuan (山西医科大学生理学系,太原030001;山西医科大学細胞生理学教育部重点実験室) ,  Li Jianguo (山西医科大学生理学系,太原030001;山西医科大学細胞生理学教育部重点実験室) ,  Zhao Xin (山西医科大学生理学系,太原030001;山西医科大学細胞生理学教育部重点実験室) ,  Xu Yong (山西医科大学第一医院精神科) ,  Yang Jiao (山西医科大学基礎医学院解剖教研室) ,  Zhang Yu (山西医科大学生理学系,太原030001;山西医科大学細胞生理学教育部重点実験室)
資料名： Shanxiyike Daxue Xuebao  (Shanxiyike Daxue Xuebao)
巻： 49  号： 3  ページ： 240-246  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3514A  ISSN： 1007-6611  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:GEOデータベース中のGSE6476シリーズチップのデータを分析対象とし、バイオインフォマティクスの方法を結合し、フルオキセチンの長期作用による抑鬱マウスの海馬関連遺伝子の発現状況を分析する。方法:R言語とBioconductor、DAVID、STRING、Uniprotなどの方法を用いて、差異遺伝子の選別と分析を行った。【結果】144の差次的遺伝子が得られ,そのうち111は上方制御され,33は下方制御された(logFC>1,P<0.05)。GO分析により、これらの差異遺伝子の中に14個の参与生物過程(BP)、16個の参与細胞の構成(CC)、9個の参与分子の機能(MF)があることを発見した。Pathway経路分析により、差異遺伝子は主にグリセリドの代謝、N-グリカンの生合成、アルギニンとプロリンの代謝経路、アラキドン酸の代謝、グリセロリン脂質の代謝に集中することを発見した。酸化的リン酸化経路,さらに分析して,78の差次的遺伝子の蛋白質産物の相互作用が存在し,Vim,Bdnf,Npy,Gfap,Penk,Fosb,およびP.Cd44、Timpl、Lgalslなどのコア遺伝子、これらの遺伝子は神経ペプチドシグナル経路、女性妊娠、樹状突起と神経発育などの生物機能において、重要な役割を果たしている。結論:フルオキセチンの長期作用前後のうつ病マウスの海馬の遺伝子発現には大きな差異があり、コア遺伝子の選別を通じてうつ病の遺伝子標的治療の指導に重要な理論的基盤を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  *遺伝子 ,  代謝経路 ,  生合成 ,  海馬 ,  ダウンレギュレーション ,  治療法 ,  *遺伝子発現 ,  アップレギュレーション ,  データベース ,  相互作用 ,  不飽和脂肪酸 ,  ポリエン ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン ,  有機フッ素化合物 ,  フェノールエーテル ,  第二アミン
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： GEO database ,  depression ,  bioinformatics

分類 (3件)： 泌尿生殖器の基礎医学  (GM01020T) ,  代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

物質索引 (3件)： アラキドン酸 ,  アルギニン ,  フルオキセチン

タイトルに関連する用語 (8件)： バイオインフォマティクス ,  抑欝 ,  マウス ,  長期 ,  フルオキセチン ,  投与 ,  差次的遺伝子発現 ,  解析