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J-GLOBAL ID:201802272694108216   整理番号:18A0400989

ダイズ(Glycinemax)の根粒から分離した根粒菌属Ensifer shofinae.nov.【Powered by NICT】

Ensifer shofinae sp. nov., a novel rhizobial species isolated from root nodules of soybean (Glycine max)
著者 (11件):
資料名:
巻: 40  号:ページ: 144-149  発行年: 2017年 
JST資料番号: W0168A  ISSN: 0723-2020  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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ダイズの根粒から分離した二株の細菌を,16S rRNA遺伝子の比較に基づくEnsifer属における異なるグループのメンバーとして系統発生的に特性化した。もrecA,atpD,glnII(≦93.9%類似性で定義された種の基準株)の連結配列分析により,および代表的歪CCBAU251167~Tの全ゲノム配列とEnsifer glycinisとEnsifer fredii(それぞれ90.5%と90.3%)における密接に関連した株の間の平均ヌクレオチド同一性(ANI)による分離基として検証した。共生遺伝子(nodCとnifH)の系統発生は,E.fredii,E.glycinisとEnsifer sojaeのいくつかのダイズ根粒形成菌株と共にこれらの二株を分類した。根粒形成試験は,代表的歪CCBAU251167~Tはその宿主植物に及ぼす窒素固定とGlycine soja(ツルマメ),Cajanus cajan,Vigna unguiculata(ササゲ),インゲンマメ(Phaseolus vulgaris)およびAstragalus membranaceusの能力を持つ根粒を形成することを認め,Leucaena leucocephalaに不活性な小結節を形成した。歪CCBAU251167~Tは脂肪酸18:1ω9c,18:0イソおよび20:0,他の関連株から異なるを含んでいた。炭素源,pH=6.0で成長と1%(w/v)NaClの不耐性としてL-トレオニンとD-セリンの利用は関連種の他の型株から歪CCBAU251167~Tを識別した。CCBAU251167~Tのゲノムサイズは6.2Mbpであったが,59.9mo1%と970のユニークな遺伝子のDNAのG+C含量7,581予測遺伝子から成る。新種Ensifer shofinae.nov.を提案した,基準株としてCCBAU251167~T(=ACCC 19939~T=LMG 29645~T)であった。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】
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微生物形態学・分類学  ,  微生物検査法 
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