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J-GLOBAL ID：201802273358593425   整理番号：18A1032007

市中感染性肺炎と菌血症患者から分離したExiguobacterium sp.A1B/GX59:ゲノム特性と文献レビュー【JST・京大機械翻訳】

Exiguobacterium sp. A1b/GX59 isolated from a patient with community-acquired pneumonia and bacteremia: genomic characterization and literature review

著者 (7件)： Chen Xingchun (Department of Laboratory Medicine, People’s Hospital of Guangxi Zhuang Autonomous Region, Nanning, China) ,  Wang Lijun (Department of Laboratory Medicine, Beijing Tsinghua Chang Gung Hospital, Tsinghua University, Beijing, China) ,  Zhou Jiali (BGI Tianjin, Tianjin, China) ,  Wu Honglong (BGI Tianjin, Tianjin, China) ,  Li Dong (Department of Laboratory Medicine, Civil Aviation General Hospital, Peking University Civil Aviation School of Clinical Medicine, Beijing, China) ,  Cui Yanchao (Department of Laboratory Medicine, Civil Aviation General Hospital, Peking University Civil Aviation School of Clinical Medicine, Beijing, China) ,  Lu Binghuai (Department of Laboratory Medicine, Civil Aviation General Hospital, Peking University Civil Aviation School of Clinical Medicine, Beijing, China)
資料名： BMC Infectious Diseases (Web)  (BMC Infectious Diseases (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 508  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7430A  ISSN： 1471-2334  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Exiguobacterium属に属する細菌種は,通性嫌気性,非胞子形成性,グラム陽性桿菌であり,ヒト感染症とまれに関連している。ここでは,中国におけるExiguobacterium spp.による市中肺炎(CAP)と菌血症の最初の症例を報告した。症例提示:重症CAPの成人男性を入院した。病原体は,血流と気管支肺胞洗浄液から分離した。微生物の正しい同定は16S rRNA配列決定を用いて達成され,その抗生物質感受性試験は微量希釈法によって行われた。Wホールゲノム配列(WGS)を用いて,その遺伝的特徴を特性化し,その潜在的病原機構を解明した。さらに,そのゲノム配列を,3つの公開可能なExiguobacterium株のそれらと比較した。PubMed感染の特徴をさらに理解するためにPubMed検索を行った。16S rRNA遺伝子配列の系統発生分析は,菌株GX59がExiguobacterium AT1b(99.7%)に最も密接に関連していることを示した。GX59のゲノムは,2855個の推定蛋白質コード遺伝子,5個のrRNAオペロン,37個のtRNA遺伝子および1個のtmRNAを含む,サイズが2,727,929bpであった。4種のExiguobacterium株の多重ゲノム比較により,Exiguobacteriumは,sec,tat,FEA,IV型Pili及び競合関連DNA変換輸送体(Com)を含む37の分泌系を含むことを示した。微生物の病原性因子は,致死的感染を引き起こすことにおいて重要な役割を果たす可能性があるTlyC,NprR,MCP,Damを含んだ。【結論】本研究は,種々の病原性因子をコードする独特の遺伝子に対するExiguobacterium属の潜在的病原性と抗生物質耐性に関連するそれらを強調し,したがって,その臨床的意義を評価すべきである。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *感染 ,  *ゲノム ,  ヒト ,  キャラクタリゼーション ,  タンパク質 ,  成人 ,  病原体 ,  中華人民共和国 ,  桿菌属 ,  抗生物質 ,  DNA【核酸】 ,  *患者 ,  病原性
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  *Exiguobacterium属 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Exiguobacterium spp. ,  全ゲノム配列決定 ,  病原因子 ,  抗生物質 ,  菌血症 ,  市中肺炎

分類 (1件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (20件)：

• J Gen Microbiol; Chemotaxonomic study of an alkalophilic bacterium, Exiguobacterium aurantiacum gen. Nov., sp. nov; MD Collins, BM Lund, F JAE, KH Schleifer; 129; 1983; 2037-2042; CR1;
• J Microbiol Immunol Infect; Bacteremia caused by Pantoea agglomerans at a medical center in Taiwan, 2000-2010; A Cheng, C-Y Liu, H-Y Tsai, M-S Hsu, C-J Yang, Y-T Huang, C-H Liao, P-R Hsueh; 46; 3; 2013; 187-194; 10.1016/j.jmii.2012.05.005; CR2;
• J Med Microbiol; Molecular identification of Exiguobacterium acetylicum as the aetiological agent of bacteraemia; Y Keynan, G Weber, H Sprecher; 56; 4; 2007; 563-564; 10.1099/jmm.0.46866-0; CR3;
• Emerg Infect Dis; Possible Exiguobacterium sibiricum skin infection in human; DMN Tena, J Casanova, JL García, E Román, MJ Medina, JA Sáez-Nieto; 20; 12; 2014; 2178-2179; 10.3201/eid2012.140493; CR4;
• Br J Biomed Sci; Potential misidentification of a new Exiguobacterium sp. as Oerskovia xanthineolytica isolated from blood culture; FXJ Kenny, BC Millar, RB McClurg, JE Moore; 63; 2; 2006; 86; 10.1080/09674845.2006.11732726; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 市中感染性肺炎 ,  菌血症 ,  患者 ,  Exiguobacterium ,  ゲノム ,  文献レビュー