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J-GLOBAL ID:201802273734065033   整理番号:18A1434480

COI遺伝子配列に基づく長腹ケンミジンコの系統発生関係【JST・京大機械翻訳】

Molecular Phylogenetic of Oithona based on COIsequence
著者 (7件):
資料名:
巻: 40  号:ページ: 92-103  発行年: 2018年 
JST資料番号: W0863A  ISSN: 0253-4193  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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Oithonaは,海洋近海と外洋海域に広く分布する中小型カイアシ類の最も豊富な類群の一つであり,個体は小さく,形態の差が微小である。伝統的な形態学的分類法により、その正確な鑑定は困難である。本論文では、南シナ海に分布する長腹のケンミジンコ属内の5種、即ち、痩長腹剣水ミジンコ(O.tenuis)、羽長腹剣水ミジンコ(O.plumifera)、刺長腹剣水ミジンコ(O.setigera,O.fallaxとO.longispinaのミトコンドリアCOI遺伝子の配列およびDNAデータベース中の長腹のケンミジンコ属の他の地域のCOI遺伝子の配列を比較分析した。ABGD(Auto-maticBarcodeGapDiscovery)とGMYC(GeneralizedMixedYuleCoalescent)モデルを使用して,種を同定した。種間の遺伝距離を分析し、系統の進化関係を構築した。結果は,ABGDとGMYCモデルが,長腹のケンミジンコの種を分類できることを示した。種内遺伝距離は0.0%1.6%,種間遺伝距離は17.7%44.5%(Kimura2-parameter二重パラメータモデル)であった。種間で高い分化を示した。ベイジアン系統樹と最大尤度樹の系統樹は,O.simplexが,他の種とより遠く離れて,P.tabilisとO.が,P.ticus(O.)とC.platyphylla(O.)の種に,より遠いことを示した。similisの中の隠種の分化は,中国の南シナ海と地中海の羽長腹のミジンコ,朝鮮海峡と北海の擬長腹のノミ,種間の遺伝距離はそれぞれ18.6%と18.6%であった。22.9%。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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魚類  ,  魚類以外の水産動物 
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