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J-GLOBAL ID：201802274001611579   整理番号：18A1139892

品種と適応応答はウシ末梢血細胞のトランスクリプトームを調節する【JST・京大機械翻訳】

Breed and adaptive response modulate bovine peripheral blood cells’ transcriptome

著者 (8件)： Poscic Nataliya (Department of Agriculture, Food, Environment and Animal Science (DI4A), University of Udine, Udine, Italy) ,  Montanari Tommaso (Department of Agriculture, Food, Environment and Animal Science (DI4A), University of Udine, Udine, Italy) ,  D’Andrea Mariasilvia (Department of Agricultural, Environmental and Food Sciences, University of Molise, Campobasso, Italy) ,  Licastro Danilo (CBM S.c.r.l, Basovizza, Italy) ,  Pilla Fabio (Department of Agricultural, Environmental and Food Sciences, University of Molise, Campobasso, Italy) ,  Ajmone-Marsan Paolo (Institute of Zootechnics, Catholic University of the Sacred Heart, Piacenza, Italy) ,  Minuti Andrea (Institute of Zootechnics, Catholic University of the Sacred Heart, Piacenza, Italy) ,  Sgorlon Sandy (Department of Agriculture, Food, Environment and Animal Science (DI4A), University of Udine, Udine, Italy)
資料名： Journal of Animal Science and Biotechnology (Web)  (Journal of Animal Science and Biotechnology (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 11  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7387A  ISSN： 2049-1891  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:適応応答は,外部または内部条件の変化に対する様々な生理学的修正を含み,新しい状況に適応する。急性期蛋白質(APP)はストレス,感染,炎症のような環境刺激に対して合成される反応物質である。【方法】イタリアのホルスタイン(IH)およびイタリアの精神(IS)品種における全血トランスクリプトーム分析を実行した環境に対する適応応答の分子構成要素の違いを明らかにする。このために,6つの商業農場からの663のIHとIS牛を,APPsの血中濃度に従ってクラスタ化した。各々の農場からの10の極端な個体(5つのAPP+とAPP-変異体)を,Illina塩基配列決定技術を用いてRNA-seqのために選択した。動的影響アプローチ(DIA)とDAVIDアノテーションクラスタリングを用いて,差別的に発現した(DE)遺伝子を分析した。乳生産データを統計学的に作成し,APP+とAPP遺伝子発現パターンの関連性を乳パラメータの変化と評価した。【結果】cDNA配列データの全体的de novo集合は,ウシ血液細胞で発現した13665の遺伝子を生成した。比較ゲノム解析により,全てのAPP+対全APP変異体の比較において1,152DE遺伝子を明らかにした。IHとIS比較に特異的な531と217DE遺伝子。全ての比較において過剰発現遺伝子は低発現遺伝子よりも多かった。David分析は,IHとISの比較において,品種,173と73DE遺伝子を横切る369のDE遺伝子を明らかにした。両品種の最も影響された経路の中で,ビタミンB6代謝,葉酸生合成,窒素代謝およびリノール酸代謝であった。結論:DIAとDAVIDアプローチの両方は,高レベルの血液APPを有するウシにおいて,適応応答に対する狭い接続を有する多数の有意に影響された遺伝子と経路を生み出した。遺伝子発現とAPP+とAPP変異体間の影響経路の類似の変化が,2つの研究品種間で見られた。そのような類似性はDE遺伝子のアノテーションクラスタ化によっても確認された。しかしながら,IH品種はIS品種と比較してより高い,より分化した影響を示し,IH適応応答におけるそのような特殊な特徴は,より高い代謝活性により説明できた。乳生産データの変化はAPP+およびAPP遺伝子発現パターンと有意に関連していた。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  血中濃度 ,  クラスタ化 ,  炎症 ,  生理学 ,  ホルスタイン ,  ヌクレオチド配列 ,  *末梢血 ,  アノテーション ,  イタリア共和国 ,  生合成 ,  *品種 ,  遺伝子発現 ,  *トランスクリプトーム

著者キーワード (7件)： 急性期蛋白質 ,  適応応答 ,  動的衝撃アプローチ(DIA) ,  視床下部-下垂体-副腎(HPA)軸 ,  RNA-seq ,  ストレス応答 ,  トランスクリプトーム

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  牛  (FD02020Y)

引用文献 (113件)：

• Front Psychiatry; Dysregulated hypothalamic-pituitary-adrenal axis function contributes to altered endocrine and neurobehavioral responses to acute stress; SA Kinlein, CD Wilson, IN Karatsoreos; 6; 2015; 31; 10.3389/fpsyt.2015.00031; CR1;
• Viral Immunol; Immune modulation of the hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axis during viral infection; MN Silverman, BD Pearce, CA Biron, AH Miller; 18; 1; 2005; 41-78; 10.1089/vim.2005.18.41; CR2;
• Nature; Syndrome produced by diverse nocuous agents; HA Selye; 138; 1936; 132; 10.1038/138032a0; CR3;
• Ann NY Acad Sci; Stress, corticotropin-releasing hormone, glucocorticoids, and the immune/inflammatory response: acute and chronic effects; IJ Elenkov, EL Webster, DJ Torpy, GP Chrousos; 876; 1999; 1-11; 10.1111/j.1749-6632.1999.tb07618.x; CR4;
• Vet Res Commun; Bovine and canine acute phase proteins; PD Eckersall, JG Conner; 12; 2-3; 1988; 169-78; 10.1007/BF00362798; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： 品種 ,  適応応答 ,  ウシ ,  末梢血 ,  細胞 ,  トランスクリプトーム ,  調節