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J-GLOBAL ID：201802274311123037   整理番号：18A1114849

CRISPR-CASサンタグ指向DNMT3Aを用いたDNAエピゲノム編集【JST・京大機械翻訳】

DNA epigenome editing using CRISPR-Cas SunTag-directed DNMT3A

著者 (20件)： Huang Yung-Hsin (Department of Developmental Biology, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Huang Yung-Hsin (Stem Cells and Regenerative Medicine Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Huang Yung-Hsin (Center for Cell and Gene Therapy, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Su Jianzhong (Division of Biostatistics, Dan L Duncan Cancer Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Lei Yong (Stem Cells and Regenerative Medicine Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Lei Yong (Center for Cell and Gene Therapy, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Brunetti Lorenzo (Stem Cells and Regenerative Medicine Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Brunetti Lorenzo (Center for Cell and Gene Therapy, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Gundry Michael C. (Stem Cells and Regenerative Medicine Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Gundry Michael C. (Center for Cell and Gene Therapy, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Gundry Michael C. (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Zhang Xiaotian (Stem Cells and Regenerative Medicine Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Zhang Xiaotian (Center for Cell and Gene Therapy, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Jeong Mira (Stem Cells and Regenerative Medicine Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Jeong Mira (Center for Cell and Gene Therapy, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Li Wei (Division of Biostatistics, Dan L Duncan Cancer Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Goodell Margaret A. (Department of Developmental Biology, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Goodell Margaret A. (Stem Cells and Regenerative Medicine Center, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Goodell Margaret A. (Center for Cell and Gene Therapy, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Goodell Margaret A. (Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine, Houston, USA)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 176  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】DNAメチル化は,発生中の遺伝子発現に広範な影響を及ぼす。しかしながら,DNAメチル化の領域に特異的な機能を割り当てる能力は,DNAメチル化の全体的パターンと遺伝子発現の間の悪い相関により制限される。【結果】Here,著者らは,抗体融合de novo DNAメチルトランスフェラーゼ3A(DNMT3A)(dCas9-SunTag-DNMT3A)の複数コピーを動員する反復ペプチドエピトープ(SunTag)に融合したヌクレアーゼ不活性化Cas9蛋白質を利用して,興味のあるゲノム部位をメチル化する局所DNMT3A濃度を増幅した。dCas9-SunTag-DNMT3Aはヒト胎児腎臓(HEK293T)細胞のHOXA5遺伝子座でCpGメチル化を劇的に増加させることを示した。さらに,単一ガイドRNAを用いて,dCas9-SunTag-DNMT3Aは4.5kbゲノム領域をメチル化し,HOXA5遺伝子発現を抑制することができた。還元された表現重亜硫酸塩基配列決定およびRNA-seqは,dCas9-SunTag-DNMT3Aが,全体的DNAメチロームおよびトランスクリプトームに対する最小の影響を持つ興味のある領域をメチル化することを示す。【結論】この効果的で正確なツールはDNAメチル化の部位特異的操作を可能にし,DNAメチル化と遺伝子発現の間の関係を扱うために使用される可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 亜硫酸水素塩 ,  ヒト ,  メチルトランスフェラーゼ ,  遺伝子発現 ,  *ゲノム ,  *DNA【核酸】 ,  トランスクリプトーム ,  胎児 ,  不活性化 ,  タンパク質 ,  メチル化 ,  ヌクレアーゼ
準シソーラス用語： Cas9 ,  DNAメチル化 ,  *エピゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (28件)：

• Trends Genet; DNA methylation and imprinting: why bother?; R Jaenisch; 13; 1997; 323-9; 10.1016/S0168-9525(97)01180-3; CR1;
• Nat Genet; Epigenetic regulation of gene expression: how the genome integrates intrinsic and environmental signals; R Jaenisch, A Bird; 33; Suppl; 2003; 245-54; 10.1038/ng1089; CR2;
• EMBO J; Activation of mammalian DNA methyltransferase by cleavage of a Zn binding regulatory domain; TH Bestor; 11; 1992; 2611-7; CR3;
• Cell; DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b are essential for de novo methylation and mammalian development; M Okano, DW Bell, DA Haber, E Li; 99; 1999; 247-57; 10.1016/S0092-8674(00)81656-6; CR4;
• Science; Global epigenomic reconfiguration during mammalian brain development; R Lister, EA Mukamel, JR Nery, M Urich, CA Puddifoot, ND Johnson, J Lucero, Y Huang, AJ Dwork, MD Schultz; 341; 2013; 1237905; 10.1126/science.1237905; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： CRISPR ,  CAS ,  Dnmt3a ,  DNA ,  エピゲノム編集