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J-GLOBAL ID：201802274416738818   整理番号：18A1189939

インドのエビ養殖場におけるLitopenaeus vannameiに影響する白点症候群ウイルスの新しい株【JST・京大機械翻訳】

A new strain of white spot syndrome virus affecting Litopenaeus vannamei in Indian shrimp farms

著者 (15件)： Sivakumar S (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Vimal S (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Abdul Majeed S (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Santhosh Kumar S (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Taju G (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Madan N (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Rajkumar T (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Thamizhvanan S (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India) ,  Shamsudheen K V (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, Delhi, India) ,  Shamsudheen K V (Academy of Scientific and Innovative Research, Delhi, India) ,  Scaria V (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, Delhi, India) ,  Scaria V (Academy of Scientific and Innovative Research, Delhi, India) ,  Sivasubbu S (CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology, Delhi, India) ,  Sivasubbu S (Academy of Scientific and Innovative Research, Delhi, India) ,  Sahul Hameed A S (OIE Reference Laboratory for WTD, C. Abdul Hakeem College, Melvisharam, India)
資料名： Journal of Fish Diseases  (Journal of Fish Diseases)
巻： 41  号： 7  ページ： 1129-1146  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1352A  ISSN： 0140-7775  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： インドのNelloreに位置する成長池から収集した白色スポット症候群ウイルス(WSSV)感染エビ試料はWSSV陰性で,WSSVのORF119とVP28遺伝子に特異的なプライマーセットを用いたPCRにより陽性であった。これはWSSVのゲノムにおける遺伝子フラグメントの欠失を示した。WSSVの実験室株とともにWSSV分離株を次世代配列決定した。配列分析はWSSV-THとWSSV-LS(研究室株)と比較してWSSV-NS(新しい株)のゲノムにおける5つの位置で13170bpの欠失を明らかにした。ORFの特異的プライマーセットを用いたPCR分析は,WSSV-NS株のゲノムにおける10のORFの完全な欠失を明らかにした。プライマーセットをORF161/162/163をカバーする配列に基づいて設計し,WSSV-LSに対して2,748bp,WSSV-NSに対して402bpの産物を増幅した。2002年以来実施された著者らのサーベイランスプログラムは,インドのエビ養殖システムにおけるWSSV-NSによるWSSV-LSの置換を明らかにした。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  *インド ,  ゲノム ,  感染
準シソーラス用語： 配列解析 ,  分離株 ,  白斑病ウイルス ,  *Litopenaeus vannamei ,  *エビ養殖 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： de novo組立 ,  hologソーム ,  新しい歪 ,  次世代シークエンシング ,  病原性 ,  白点症候群ウイルス

分類 (2件)： 魚類以外の水産動物  (FH02030V) ,  ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

タイトルに関連する用語 (6件)： インド ,  エビ養殖 ,  Litopenaeus ,  白点症候群 ,  ウイルス ,  株