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J-GLOBAL ID：201802274691985835   整理番号：18A0926320

内部寄生Xylariaの無傷細胞質量分析(マトリックス支援レーザ脱離/イオン化線形飛行時間質量分析)のための試料調製の最適化【JST・京大機械翻訳】

Optimization of sample preparation for intact cell mass spectrometry (matrix-assisted laser desorption/ionization linear time-of-flight mass spectrometry) of endophytic Xylaria

著者 (7件)： da Silva Amaral Luciana (Departamento de Quimica, Universidade Federal de Sao Carlos CP 676, 13,565-905, Sao Carlos, SP, Brazil) ,  da Silva Amaral Luciana (Institute of Chemical Technologies and Analytics, TU Wien (Vienna University of Technology), Getreidemarkt 9/164, A-1060, Vienna, Austria) ,  Rodrigues-Filho Edson (Departamento de Quimica, Universidade Federal de Sao Carlos CP 676, 13,565-905, Sao Carlos, SP, Brazil) ,  Kubicek Christian P. (Institute of Chemical, Environmental and Bioscience Engineering, TU Wien (Vienna University of Technology), Getreidemarkt 9/166, A-1060, Vienna, Austria) ,  Herwig Christoph (Institute of Chemical, Environmental and Bioscience Engineering, TU Wien (Vienna University of Technology), Getreidemarkt 9/166, A-1060, Vienna, Austria) ,  Marchetti-Deschmann Martina (Institute of Chemical Technologies and Analytics, TU Wien (Vienna University of Technology), Getreidemarkt 9/164, A-1060, Vienna, Austria) ,  Allmaier Guenter (Institute of Chemical Technologies and Analytics, TU Wien (Vienna University of Technology), Getreidemarkt 9/164, A-1060, Vienna, Austria)
資料名： Rapid Communications in Mass Spectrometry  (Rapid Communications in Mass Spectrometry)
巻： 32  号： 10  ページ： 815-823  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0695A  ISSN： 0951-4198  CODEN： RCMSEF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Xylaria属の真菌類の果実体は多様な形態学的特性を示すが,それらの菌糸型は常に非常に類似しており,それらの同定に困難を課している。マトリックス支援レーザ脱離/イオン化飛行時間型質量分析(MALDI-TOFMS)を用いた無傷細胞質量分析(ICMS)は,果実体が利用できない場合のXylaria種の分化/同定を支援する迅速で信頼できる戦略である。【方法】試料調製および培養培地のような多くの実験パラメータは,MALDI-TOFMSによる糸状真菌分析に重要である。本研究の目的のために,マトリックス中のTFAの5つの異なる濃度(0.1,0.3,0.5,1.0及び2.5%),6つの異なる培養培地(固体及び液体)及び3つの菌糸体ペプチド/蛋白質抽出プロトコル(酸,塩基及びチモール支持溶液)を用いて,内部寄生菌類X.arabulcaの試料調製を最適化した4つのマトリックス(CHCA,DHB,FA及びSA)を用いた。【結果】:アセトニトリル/0.1%TFAとPDAに溶解したシナピン酸(30mg/mL)が,それぞれ,X.arbulaのICMSに対して,最良のマトリックス溶液と培養培地であったことが観察された。ギ酸と炭酸水素アンモニウム(AB)プロトコルは,類似の質量スペクトルを提供した。しかし,AB抽出を用いて,より多くのピークが観察された。異なるチモール含有溶液(EtOH/水性0.1%TFA及びACN/水性0.1%TFA)から得られた質量スペクトルはm/z3000~6500でピーク存在量の増加を示した。【結論】:X.arabulaは,ICMSによって分析することができた。しかし,適切なMALDI質量スペクトルを得るためには抽出段階が必要であった。ギ酸,ABおよびチモール含有溶液は,これらの菌類からのペプチド/蛋白質バイオマーカーの抽出のための良好なカクテルであることを示した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *脱着 ,  *最適化 ,  *質量分析 ,  ペプチド ,  *試料調製 ,  プロトコル ,  質量スペクトル ,  バイオマーカー ,  菌糸 ,  タンパク質 ,  *イオン化 ,  MALDI-TOF MS ,  フェノール類 ,  脂肪族カルボン酸
準シソーラス用語： *Xylaria , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 有機化合物の物理分析  (CC03034A) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

物質索引 (2件)： チモール ,  ギ酸

タイトルに関連する用語 (12件)： Xylaria ,  無傷 ,  細胞 ,  質量分析 ,  マトリックス ,  支援 ,  レーザ ,  脱離 ,  イオン化線 ,  飛行時間質量分析 ,  試料調製 ,  最適化