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J-GLOBAL ID：201802274731411207   整理番号：18A1198080

部分的HIV C2V3エンベロープ配列分析は,HAARTのケニア人患者における共受容体親和性,エンベロープグリコシル化およびウイルス遺伝子型変異性の関連を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Partial HIV C2V3 envelope sequence analysis reveals association of coreceptor tropism, envelope glycosylation and viral genotypic variability among Kenyan patients on HAART

著者 (16件)： Kitawi Rose C. (Center for Research in Therapeutic Sciences, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Kitawi Rose C. (Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Nairobi, Kenya) ,  Hunja Carol W. (Center for Research in Therapeutic Sciences, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Hunja Carol W. (South Eastern Kenya University, Kitui, Kenya) ,  Aman Rashid (Center for Research in Therapeutic Sciences, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Aman Rashid (African Center for Clinical Trials, Nairobi, Kenya) ,  Aman Rashid (Kenya Medical Research Institute, Nairobi, Kenya) ,  Ogutu Bernhards R. (Center for Research in Therapeutic Sciences, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Ogutu Bernhards R. (Institute of Healthcare Management, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Ogutu Bernhards R. (Kenya Medical Research Institute, Nairobi, Kenya) ,  Muigai Anne W. T. (Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Nairobi, Kenya) ,  Kokwaro Gilbert O. (Institute of Healthcare Management, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Ochieng Washingtone (Center for Research in Therapeutic Sciences, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Ochieng Washingtone (Institute of Healthcare Management, Strathmore University, Nairobi, Kenya) ,  Ochieng Washingtone (Kenya Medical Research Institute, Nairobi, Kenya) ,  Ochieng Washingtone (Immunology and Infectious Diseases Dept, Harvard School of Public Health, Boston, USA)
資料名： Virology Journal (Web)  (Virology Journal (Web))
巻： 14  号： 1  ページ： 29  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7347A  ISSN： 1743-422X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】HIV-1は遺伝的および蛋白質レベルで非常に可変性があり,抗ウイルス免疫および治療のために使用される。本研究の目的は,HIVサブタイプの差異が異なるウイルス学的治療結果を経験しているHAART患者の間のグリコシル化パターンおよび共受容体指向性の変化と関連しているかどうかを評価することであった。【方法】高度に活性な抗レトロウイルス療法(HAART)を受けている59人のケニア患者から以前に発生した合計118のHIV env C2V3配列分離株を,トロピズムとグリコシル化パターンのために検査した。潜在的N-結合グリコシル化部位(PNGs)の分析のために,NCBIの翻訳後ツールにより生成されたアミノ酸配列を,Los Alamosデータベース内のHIVALignとN-グリコサイトツールに適用した。ウイルスのトロピズムは,Geno2pheno(G2P),WebPSSMおよびPhenosseqプラットフォームを用いて評価された。また,RymondおよびEsbjornssonの規則を用いた。CHI二乗検定を用いて,スケール変数に適用した独立変数相関とANOVAを決定した。【結果】Gen2フェノプラットフォーム内のCXCR4使用に対する5%(p=0.045),10%(p=0.016)および20%(p=0.005)のそれぞれの偽陽性率(FPR)カットオフ値において,HIV-1サブタイプおよびウイルス指向性は,カイ二乗検定において有意に関連していた。Lymond則(p=0.024)とWebPSSM(p=0.05)はサブタイプとトロピズムの間に有意な相関を示したが,PhenosseqまたはEsbjornssonは示さなかった。用いた他のプラットフォームと比較して,レイモンドとEsbjornssonのルールはX4変異体の割合が高かったが,WebPSSMはサブタイプにわたるX4変異体の割合が低かった。平均グリコシル化密度はサブタイプ間で有意に異なっていた。すなわち,N277(p=0.034),N296(p=0.036),N302(p=0.034)およびN366(p=0.004)であり,HIV-1Dはサブタイプを最も強くグリコシル化していた。R5分離株はX4分離株よりPNGが少なかったが,これらの差異はN262の位置を除いて有意ではなかった(p=0.040)。ウイルス学的治療成功被験者からの細胞関連分離株は,NXT(p=0.016)およびすべてのパターン(p=0.011)の両方に対してウイルス学的治療失敗からの無細胞分離株よりもグリコシル化されていた。【結論】これらのデータは,HIV-1サブタイプ多様性,ウイルス共受容体指向性,ウイルス抑制およびエンベロープグリコシル化の有意な関連を明らかにする。これらの関連は,HIVに対する治療とワクチンの設計に重要な意味を持つ。HIV-1DのCXCR4使用に対する重いグリコシル化と選択は,これらの株に感染した患者における急速な疾患進行を説明する可能性がある。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸配列 ,  *遺伝 ,  屈性 ,  *患者 ,  指向性 ,  治療法 ,  分散分析 ,  *親和性 ,  *ケニア共和国 ,  HIV1 ,  ワクチン ,  データベース ,  *グリコシル化
準シソーラス用語： 分離株 ,  サブタイプ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： HIV-1 ,  サブタイプ ,  潜在的N-結合グリコシル化 ,  親和性 ,  治療 ,  アフリカ ,  ケニア

分類 (2件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (63件)：

• Science; Chimpanzee reservoirs of pandemic and nonpandemic HIV-1; BF Keele; 313; 5786; 2006; 523-526; 10.1126/science.1126531; CR1;
• Nat Med; A new human immunodeficiency virus derived from gorillas; JC Plantier, M Leoz, JE Dickerson; 15; 8; 2009; 871-872; 10.1038/nm.2016; CR2;
• Foley B, et al. (2013) HIV Sequence Compendium 2013 (Theoretical Biology and Biophysics Group, Los Alamos National Laboratory, NM, LA-UR 13-26007).
• Worobey M (2007) The Origins and Diversification of HIV. Global HIV/AIDS Medicine:13-21.
• Viral Mol Mach Adv Exp MedBiol; Molecular Mechanisms of HIV Entry; CB Wilen, JC Tilton, RW Doms; 726; 2012; 223-242; 10.1007/978-1-4614-0980-9_10; CR5;

タイトルに関連する用語 (11件)： HIV ,  エンベロープ ,  配列分析 ,  HAART ,  ケニア ,  患者 ,  受容体 ,  親和性 ,  グリコシル化 ,  ウイルス ,  遺伝子型変異