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J-GLOBAL ID：201802275018301774   整理番号：18A1686391

同種異形成性フナから分離された新しい株,コイヘルペスウイルス2の完全ゲノム【JST・京大機械翻訳】

The complete genome of Cyprinid herpesvirus 2, a new strain isolated from Allogynogenetic crucian carp

著者 (15件)： Liu Bo (School of Biology & Basic Medical Science, Soochow University, Suzhou 215123, China) ,  Liu Bo (Agricultural Biotechnology Research Institute, Agricultural biotechnology and Ecological Research Institute, Soochow University, Suzhou, 215123, China) ,  Zhou Yang (Aquaculture Technical Extension Station of Dafeng City, Dafeng 224100, China) ,  Li Kun (School of Biology & Basic Medical Science, Soochow University, Suzhou 215123, China) ,  Li Kun (Agricultural Biotechnology Research Institute, Agricultural biotechnology and Ecological Research Institute, Soochow University, Suzhou, 215123, China) ,  Hu Xiaolong (School of Biology & Basic Medical Science, Soochow University, Suzhou 215123, China) ,  Hu Xiaolong (Agricultural Biotechnology Research Institute, Agricultural biotechnology and Ecological Research Institute, Soochow University, Suzhou, 215123, China) ,  Wang Chonglong (School of Biology & Basic Medical Science, Soochow University, Suzhou 215123, China) ,  Wang Chonglong (Agricultural Biotechnology Research Institute, Agricultural biotechnology and Ecological Research Institute, Soochow University, Suzhou, 215123, China) ,  Cao Guangli (School of Biology & Basic Medical Science, Soochow University, Suzhou 215123, China) ,  Cao Guangli (Agricultural Biotechnology Research Institute, Agricultural biotechnology and Ecological Research Institute, Soochow University, Suzhou, 215123, China) ,  Xue Renyu (School of Biology & Basic Medical Science, Soochow University, Suzhou 215123, China) ,  Xue Renyu (Agricultural Biotechnology Research Institute, Agricultural biotechnology and Ecological Research Institute, Soochow University, Suzhou, 215123, China) ,  Gong Chengliang (School of Biology & Basic Medical Science, Soochow University, Suzhou 215123, China) ,  Gong Chengliang (Agricultural Biotechnology Research Institute, Agricultural biotechnology and Ecological Research Institute, Soochow University, Suzhou, 215123, China)
資料名： Virus Research  (Virus Research)
巻： 256  ページ： 6-10  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0381D  ISSN： 0168-1702  CODEN： VIREDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 鰓の出血性疾患はCyprinus herpesvirus2(CyHV2)感染によって引き起こされ,それはしばしば,Allogynogenicフナ(ACC)の農場における深刻な経済的損失をもたらす。本研究において,中国,江蘇省,Sheyang郡から収集したCyHV2株CyHV2-SY(SY)のゲノムを配列した。SYの完全ゲノムは,154の潜在的オープンリーディングフレーム(ORF)と15353bpの末端直接反復(TR)を有する290,455bpの長さである。配列決定されたCyHV2ゲノムを比較することにより,多くの変異が見出された。SYゲノムのORF10,ORF107,ORF156はST-J1およびSY-C1と比較して反復配列の挿入または欠失を有し,SY株の標識として使用される可能性がある。さらに,プロモーター配列分析は,150ORFのうち13がTATAボックス要素を有し,150ORFの119がプロモーター領域(開始コドンATGの350bp上流配列)にSP1シス作用要素を有することを示した。28のウイルスmiRNA候補はCyHV2ゲノムで予測され,24のウイルス遺伝子の発現はウイルスmiRNAによって制御される可能性がある。水平移動分析は,CyHV2ゲノムにおける16および2遺伝子がそれぞれ宿主および細菌から移動する可能性を示した。ゲノム配列決定と配列マイニングによって,著者らの結果は,さらなるCyHV2ゲノムを理解するためのより新しい手掛かりを提供した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  アノテーション ,  反復配列 ,  遺伝子 ,  開始コドン ,  農場 ,  プロモーター領域 ,  感染 ,  細菌 ,  ウイルス遺伝子
準シソーラス用語： *ヘルペスウイルス ,  ゲノム配列 ,  マイクロRNA ,  オープンリーディングフレーム ,  江蘇省 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： コイ科ヘルペスウイルス2 ,  同種異形成性フナ ,  完全ゲノム ,  シークエンシング ,  ゲノムアノテーション

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (5件)： 異形成 ,  フナ ,  株 ,  コイヘルペスウイルス ,  ゲノム