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J-GLOBAL ID：201802275134204267   整理番号：18A1290187

カッサバ(Manihot esculenta Crantz)における非生物的ストレス下のKupファミリーのゲノムワイド同定と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the KUP Family under Abiotic Stress in Cassava (Manihot esculenta Crantz)

著者 (13件)： Ou Wenjun (Tropical Crops Genetic Resources Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Mao Xiang (Wuhan Centre for Disease Prevention and Control) ,  Huang Chao (College of Life Science and Technology, Huazhong University of Science and Technology (HUST)) ,  Tie Weiwei (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Yan Yan (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Ding Zehong (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Wu Chunlai (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Xia Zhiqiang (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Wang Wenquan (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Zhou Shiyi (Hubei Key Laboratory of Purification and Application of Plant Anticancer Active Ingredients, Chemistry and Biology Science College, Hubei University of Education) ,  Li Kaimian (Tropical Crops Genetic Resources Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Li Kaimian (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences) ,  Hu Wei (Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences)
資料名： Frontiers in Physiology (Web)  (Frontiers in Physiology (Web))
巻： 9  ページ： 17  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7093A  ISSN： 1664-042X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： KT/HAK/KUP(KUP)ファミリーはカリウムイオン(K+)輸送に関与し,浸透圧バランスを維持することにより植物の非生物的ストレスへの応答に重要な役割を果たす。しかしながら,干ばつ耐性作物カッサバ(Manihot esculenta Crantz)におけるKUPファミリーの機能の理解は限られている。本研究において,21のキャッサバKUP遺伝子(MeKUPs)を同定し,系統発生的関係,保存モチーフ及び遺伝子構造解析に基づいて4つのクラスターに分類した。トランスクリプトーム解析は,3つの遺伝子型の様々な組織におけるカッサバKUPSの発現多様性を明らかにした。比較トランスクリプトーム解析により,干ばつによるMeKUP遺伝子の活性化は,Arg7およびW14遺伝子型の葉におけるよりも根において多かったが,SC124品種の葉におけるよりも根において少ないことを示した。これらの知見は,異なるカッサバ遺伝子型がKUP遺伝子により仲介される種々の干ばつ耐性機構を利用することを示す。特異的なKUP遺伝子は,塩,浸透圧,低温,H2O2およびアブシシン酸(ABA)処理後に広いアップレギュレーションを示した。まとめると,本研究は転写レベルでのカッサバのKUP仲介干ばつ応答への洞察を提供し,非生物ストレスへの作物耐性改善に利用できる候補遺伝子を同定する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 低温 ,  アップレギュレーション ,  遺伝子 ,  系統発生 ,  遺伝子型 ,  浸透圧 ,  *カッサバ ,  干ばつ ,  品種 ,  クラスタ ,  遺伝子発現 ,  耐干性
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  トランスクリプトーム解析 ,  *非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： カッサバ ,  干ばつストレス ,  遺伝子発現 ,  同定 ,  KUPファミリー

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： サバ ,  Manihot ,  非生物的ストレス ,  ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  発現解析