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J-GLOBAL ID：201802275739706204   整理番号：18A0965608

有意な正の選択による選択的スイープは,ジャポニカおよびインディカ米栽培品種の分化のための駆動力として働く【JST・京大機械翻訳】

Selective sweep with significant positive selection serves as the driving force for the differentiation of japonica and indica rice cultivars

著者 (10件)： Yuan Yang (The Applied Plant Genomics Laboratory, College of Agricultural Sciences, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Yuan Yang (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Zhang Qijun (Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing, China) ,  Zeng Shuiyun (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Gu Longjiang (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Si Weina (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Zhang Xiaohui (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Tian Dacheng (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Yang Sihai (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China) ,  Wang Long (State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, School of Life Sciences, Nanjing University, Nanjing, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 307  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ジャポニカおよびインディカを含むアジア栽培イネ(Oryza sativa L.)は,アジアおよび世界中で最も重要な作物である。しかし,その起源と栽培過程の決定的な結論はまだ欠けている。今日,多数の米試料の増加する高スループット配列データは,これらの質問の答えに近い新しい機会を提供している。【結果】296の全ゲノム配列化イネ品種と39の多様な野生イネを編集することにより,異なるグループ間の強い選択的掃引シグナルを持つ2つのタイプの栽培地域(DR-IとDR-II)を検出した。DR-I領域は,ジャポニカとインディカ亜種の間で有意に分化した28のブロックを含み,一方,DR-II領域は,野生と栽培米の間で有意に分化した別の28のブロックから成り,それぞれ,890kbと640KBをカバーした。深さ分析は,DR-IsとDR-IIの両方がインド-中国半島から中国南部に由来し,DR-IIがインディカからジャポニカに移入される可能性があることを示唆した。有意な正の選択を伴う機能的バイアスもDR-Iの遺伝子において検出され,ジャポニカとインディカの分化における選択的掃引の重要な役割を示唆した。【結論】本研究は,ジャポニカおよびインディカにおけるDR-Isが中国南部から中国南部における分岐野生イネから独立して生じ,その後頻繁な遺伝子移入が続く栽培イネの起源の新しい可能性のあるモデルを促進した。有意な正の選択と偏った機能を有する遺伝子も検出され,それはイネの栽培と分化過程において重要な役割を果たすことができた。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 中国南部 ,  中華人民共和国 ,  *栽培 ,  農作物 ,  アジア ,  遺伝子導入 ,  *分化 ,  半島 ,  *栽培品種 ,  遺伝子 ,  日本 ,  インド
準シソーラス用語： 亜種 ,  ゲノム配列 ,  *インディカ米 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 日本 ,  インディカ ,  野生イネ ,  家畜化 ,  再配列 ,  機能遺伝子

分類 (1件)： 稲作  (FC03020C)

引用文献 (51件)：

• Proc Natl Acad Sci; Dissecting yield-associated loci in super hybrid rice by resequencing recombinant inbred lines and improving parental genome sequences; Z-Y Gao, S-C Zhao, W-M He, L-B Guo, Y-L Peng, J-J Wang; 110; 2013; 14492-7; 10.1073/pnas.1306579110; CR1;
• Genet Mol Biol; Comparative proteomic analysis of indica and japonica rice varieties; Y Yang, K Zhu, H Xia, L Chen, K Chen; 37; 2014; 652-61; 10.1590/S1415-47572014005000015; CR2;
• Origin of Cultivated Rice. Elsevier; HI Oka; 1988; CR3;
• Genetics; Experimental studies on the origin of cultivated rice; H Oka; 78; 1974; 475-86; CR4;
• Mol Ecol; Phylogeography of Asian wild rice, Oryza rufipogon: a genome-wide view; P Huang, J Molina, JM Flowers, S Rubinstein, SA Jackson, MD Purugganan; 21; 2012; 4593-604; 10.1111/j.1365-294X.2012.05625.x; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： スイープ ,  インディカ米 ,  栽培品種 ,  分化 ,  駆動力