淡水再循環水産養殖システムの操作はアンモニア酸化古細菌とComamox nitrospiraの安定な硝化コンソーシアムの周辺でバイオフィルタ細菌群集シフトを駆動する【JST・京大機械翻訳】

Bartelme Ryan P.; McLellan Sandra L.; Newton Ryan J.

文献

J-GLOBAL ID：201802275884151986 整理番号：18A0785961

淡水再循環水産養殖システムの操作はアンモニア酸化古細菌とComamox nitrospiraの安定な硝化コンソーシアムの周辺でバイオフィルタ細菌群集シフトを駆動する【JST・京大機械翻訳】

Freshwater Recirculating Aquaculture System Operations Drive Biofilter Bacterial Community Shifts around a Stable Nitrifying Consortium of Ammonia-Oxidizing Archaea and Comammox Nitrospira

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巻： 8 ページ： 101 発行年： 2017年
JST資料番号： U7080A ISSN： 1664-302X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

再循環水産養殖システム(RAS)は,栄養素汚染排出を低減することにより環境摂動を最小化するユニークな工学生態系である。RASは魚蛋白質異化の副産物として生産されるアンモニアレベルを制御するためにバイオフィルタを典型的に使用する。Nitrosomonas(アンモニア酸化),NitrospiraおよびNitrobacter(亜硝酸塩酸化)種は,RASバイオフィルタに存在する主要な硝化菌であると考えられている。著者らは,>15年間運転されている商業規模淡水RASのバイオフィルタ細菌および古細菌コミュニティを特性化することにより,この主張を探求した。著者らは,バイオフィルタコミュニティがChitinophagaceae(~12%)とAcidobacteria(~9%)によって支配された多様な細菌分類群(>1000世代レベル分類群)を持っていることを見出した。細菌群集は,バイオフィルタの深さの変化に伴って有意な組成シフトを示し,魚の飼育サイクルを通しての操作変化と関連していた。古細菌も豊富で,AoAアンモニアモノオキシゲナーゼ遺伝子の存在からアンモニア酸化古細菌(AOA)と考えられているThaumarchaota(>95%)の低多様性集団のみから成っていた。Nitrosomonasはすべての深さと時点で存在した。しかし,それらの豊度はAOAよりも>3桁小さく,AOAでは観察されない有意な深さ-時間変動を示した。亜硝酸酸化還元酵素βサブユニット(nxrB)遺伝子の系統発生分析は,2つの異なるNitrospira集団が存在することを示したが,Nitrobacterは検出されなかった。nxrB遺伝子型の系統発生的配置と定量化に関連したNitrospira アンモニアモノオキシゲナーゼαサブユニット遺伝子の同定は,完全なアンモニア酸化(comamox)を示唆し,亜硝酸酸化Nitrospira集団はこの系において比較的同等で安定な豊度と共存する。その組成が典型的なシステム操作により直接影響を受けるが,硝化コンソーシアム内の複数のアンモニア酸化ライフスタイルを支援する,RASバイオフィルタは複雑な微生物群集を持つように見える。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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微生物の生態

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