形状の適用はヒト寄生虫Entamoeba histolyticaにおける正常および成長応力条件下でのin vivo RNA折畳みを明らかにする【Powered by NICT】

Ray Ashwini Kumar; Naiyer Sarah; Singh Shashi Shekhar; Bhattacharya Alok; Bhattacharya Sudha

文献

J-GLOBAL ID：201802276051077570 整理番号：18A0128465

形状の適用はヒト寄生虫Entamoeba histolyticaにおける正常および成長応力条件下でのin vivo RNA折畳みを明らかにする【Powered by NICT】

Application of SHAPE reveals in vivo RNA folding under normal and growth-stressed conditions in the human parasite Entamoeba histolytica

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資料名：
巻： 219 ページ： 42-51 発行年： 2018年
JST資料番号： T0912A ISSN： 0166-6851 CODEN： MBIPDP 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

プライマー伸長(SHAPE)による分析した選択的2′-ヒドロキシルアシル化はin vivoおよびin vitroでのRNA構造を徹底調査するための多用途配列非依存性方法である。はこれまで主にモデル生物を試みた。はEntamoeba histolytica,ヒトの原生動物寄生体の細胞がin vivoで形状試薬,NAIに超感受性と,生存率およびRNA完全性の急速な消失を示した。RNA完全性を保持しながらNAI改質を得るために5.8S rRNAとEh_U3snoRNAと処理条件を最適化した。修飾パターンは高度に再現性があった。in vivo折畳みはin vitroでから異なっており,in vivoでの蛋白質と5.8S rRNAの既知の相互作用と良く相関した。Eh_U3snoRNAはそのin vivo対in vitro折畳み,18S rRNAおよび5′-ETSとこのRNAの保存された相互作用と相関する多くの違いを示した。さらに,血清枯渇細胞から得られたEh_U3snoRNAは開放3′-ヒンジ構造,5′-ETS相互作用の破壊を示した。は飢餓細胞におけるrRNA前駆体の観測された遅い処理に寄与する可能性がある。著者らの研究は,寄生虫におけるin vivo RNA折畳みを研究するための形状の適用性を示し,他の生物におけるRNA構造解析のためのこの試薬の利用を促進するだろう。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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微生物の生化学 , 遺伝子発現

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