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J-GLOBAL ID：201802276208483164   整理番号：18A0236886

全ゲノム関連地域配列決定における関節量的形質依存性および遺伝子型依存サンプリングのための相設計【Powered by NICT】

Two-phase designs for joint quantitative-trait-dependent and genotype-dependent sampling in post-GWAS regional sequencing

著者 (5件)： Espin-Garcia Osvaldo (Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, Toronto, ON, Canada) ,  Espin-Garcia Osvaldo (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, Toronto, ON, Canada) ,  Craiu Radu V. (Department of Statistical Sciences, University of Toronto, Toronto, ON, Canada) ,  Bull Shelley B. (Dalla Lana School of Public Health, University of Toronto, Toronto, ON, Canada) ,  Bull Shelley B. (Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute, Sinai Health System, Toronto, ON, Canada)
資料名： Genetic Epidemiology  (Genetic Epidemiology)
巻： 42  号： 1  ページ： 104-116  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2580A  ISSN： 0741-0395  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 全コホートにおける地域配列決定のコストが高い場合,ゲノムワイド関連研究(GWAS)からの追跡所見2相設計を評価した。は全ゲノム関連研究後の推論のための調整セミパラメトリック最尤定式化の下で新しい期待値最大化ベース推論を開発した。GWAS SNP(SNPは一塩基多型)は配列変異体と正規分布量的形質(QT)間の関係推論における代理共変量として役立つ。試験妥当性を評価し,シミュレーションによる代替試料配分下における結合型QT SNP依存サンプリングと分析の効率と出力を定量化した。SNP遺伝子型と極端なQT層の平衡結合割当はQTまたはSNP配分と比較して大きな出力改善を得た。は,提案した方法を説明し,収縮期血圧の配列決定研究からのデータを用いたサンプリング変動試料配置の感度を評価した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 正規分布 ,  ゲノムワイド関連解析 ,  収縮期血圧 ,  最尤法 ,  定式化 ,  *遺伝子型 ,  一塩基多型 ,  母集団 ,  *ゲノム
準シソーラス用語： 共変量 ,  EMアルゴリズム ,  *量的遺伝形質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： マッピング ,  ワークショップ19遺伝的解析 ,  遺伝的関連研究 ,  関節転帰共変量依存サンプリング ,  転帰 /共変量依存的サンプリング

分類 (5件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (8件)： ゲノム ,  地域 ,  関節 ,  量的形質 ,  依存性 ,  遺伝子型 ,  サンプリング ,  設計