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J-GLOBAL ID：201802276987686463   整理番号：18A1132454

分子モーター移動速度論 微視的動力学パラメータを決定するためのモンテカルロ計算機シミュレーションの応用【JST・京大機械翻訳】

Molecular motor translocation kinetics: Application of Monte Carlo computer simulations to determine microscopic kinetic parameters

著者 (3件)： LeGresley Sarah E. (Department of Physics and Astronomy, University of Kansas, 1251 Wescoe Hall Dr., 1082 Malott Hall, Lawrence, KS 66045, USA) ,  Briggs Koan (Department of Physics and Astronomy, University of Kansas, 1251 Wescoe Hall Dr., 1082 Malott Hall, Lawrence, KS 66045, USA) ,  Fischer Christopher J. (Department of Physics and Astronomy, University of Kansas, 1251 Wescoe Hall Dr., 1082 Malott Hall, Lawrence, KS 66045, USA)
資料名： BioSystems  (BioSystems)
巻： 168  ページ： 8-25  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0286B  ISSN： 0303-2647  CODEN： BSYMBO  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： フィラメント(例えば,核酸とポリペプチド)に沿ったモーター蛋白質の移動を研究する方法は,典型的にADPの全生産,特定の位置(しばしばフィラメントの一端)からのモーター蛋白質の到着/出発,またはフィラメントからのモーター蛋白質の解離をモニターする。関連する速度論的時間経過は,巨視的速度論パラメータ(例えば,移動速度と過程性)と微視的速度論パラメータ(例えば,律速段階に対する速度論的ステップサイズと速度定数)を推定するために,簡単な逐次均一nステップ機構を用いて解析される。これらの逐次均一nステップ機構は,フィラメントに沿った前方運動の均一で不可逆的な律速段階の繰り返しを仮定する。不均一運動の存在(例えば,後方運動,ランダムな休止,または跳躍)がそのような解析から得られたパラメータの推定にどのように影響するかを決定するために,単純な逐次一様nステップモデルを用いて不均一運動を含む計算機シミュレーション転座時間コースを評価した。シミュレーションの入力パラメータによるこれらのシミュレーションにより生成されたデータの解析から推定された速度論パラメータを比較することにより,運動パラメータのそれが運動蛋白質の不均一運動により推定される可能性があるかどうかを決定することができた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 不可逆性 ,  ポリペプチド ,  フィラメント ,  *速度論 ,  跳躍現象 ,  *モンテカルロ法 ,  律速 ,  パラメータ推定 ,  モータータンパク質 ,  転座 ,  核酸 ,  タンパク質 ,  *計算機シミュレーション
準シソーラス用語： 速度定数 ,  *移動速度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： トランスロカーゼ ,  動力学 ,  ATPアーゼ ,  ヘリカーゼ ,  モーター蛋白質 ,  nステップ模型

分類 (5件)： 脂肪族アルコール  (CF03090H) ,  神経の基礎医学  (GN01020W) ,  中性子回折法  (BK01060A) ,  高分子の分解,劣化  (CG03010A) ,  化学分析一般  (CC07010Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 分子モーター ,  移動速度 ,  動力学 ,  パラメータ ,  モンテカルロ ,  計算機シミュレーション ,  応用