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J-GLOBAL ID：201802277162449207   整理番号：18A1825870

メタゲノム法による養豚発酵床微生物群の季節的変化の解析【JST・京大機械翻訳】

Seasonal variation, based on metagenomic analysis, in the bacterial community of a microbial fermentation-bed used for pig-raising

著者 (5件)： Chen Qianqian (福建省農業科学院農業生物資源研究所,福州,350003) ,  Liu Bo (福建省農業科学院農業生物資源研究所,福州,350003) ,  Wang Jieping (福建省農業科学院農業生物資源研究所,福州,350003) ,  Zhu Yujing (福建省農業科学院農業生物資源研究所,福州,350003) ,  Zhang Haifeng (福建省農業科学院農業生物資源研究所,福州,350003)
資料名： Nongye Huanjing Kexue Xuebao  (Nongye Huanjing Kexue Xuebao)
巻： 37  号： 6  ページ： 1240-1247  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2714A  ISSN： 1672-2043  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 夏季と冬季の微生物発酵床の細菌群集構造を明らかにするため、季節性温度における発酵床の細菌群落の変化を明らかにし、発酵床の有機物分解菌の多様性を究明し、メタゲノム法に基づき、発酵床微生物群の季節性変化を分析した。クッションメタゲノムDNAを抽出し、原核生物16SrDNA遺伝子V3-V4領域を増幅し、Illuminaを用いてハイスループットシークエンシングを行った。熱図を構築し、2つの季節微生物の遷移を分析した。RDA(冗長分析)は,クッションフローラと季節性温度の間関係性を研究するために使用した。PICRUStにより2つの季節細菌の代謝レベルを比較した。34,70,260,1843のOTUsを含む762923の配列を得た。夏季と冬季の細菌群集構造は異なり、前者はもっと豊富な細菌類群がある。2つの季節の微生物発酵床の優勢細菌は,バクテロイデス門,厚壁菌門,プロテオバクテリア門,および放線菌門であった。門レベルで、夏季サンプル中の放線菌門と異常球菌-生熱菌門の含有量は冬季サンプルより高く、後者のバクテリオバクテリア門と変形菌門の含有量は前者より高かった。夏の有機物分解細菌は,主に,特に,Pseudomonas属と砂漠川属であり,冬には,主に,Pseudomonas属とS.aeruginosaであり,それぞれ,高温と低温環境に適応した。PICRUSt分析は,夏の発酵床における細菌代謝炭水化物,脂質,およびアミノ酸代謝遺伝子の数が冬のものより高いことを示した。研究により、温度が微生物発酵床の細菌群落に影響する重要な要素であり、夏季の微生物発酵床細菌群落はより高い豊富度と多様性を持ち、代謝レベルは冬季のマットより高いことが分かった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Pseudomonas ,  *季節的変動 ,  *発酵 ,  細菌 ,  原核生物 ,  遺伝子 ,  *微生物 ,  冬 ,  夏 ,  DNA【核酸】 ,  河川 ,  *ミクロフローラ
準シソーラス用語： プロテオバクテリア ,  細菌群集 ,  *メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (7件)： メタゲノム ,  養豚 ,  発酵 ,  床 ,  微生物群 ,  季節的変化 ,  解析